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文檔簡介
1、目的:
研究藥物雷帕霉素作用于非小細(xì)胞肺癌LK2細(xì)胞后microRNA表達(dá)的變化。
方法:
于培養(yǎng)瓶中培養(yǎng)非小細(xì)胞肺癌LK2細(xì)胞,加入終濃度為1umol/L的雷帕霉素溶液,采用加入等量的RPMI-1640培養(yǎng)基作為陰性對照,在培養(yǎng)溫箱中過夜培養(yǎng)48小時之后,在培養(yǎng)瓶內(nèi)加入1ml試劑Trizol,并使其充分接觸細(xì)胞,從肺癌LK2細(xì)胞中提取RNA后,首先制備cDNA文庫,將cDNA文庫上機測序。采用了Illum
2、ina HiSeqTM 2500 microRNA測序方法進(jìn)行microRNA測序,檢測雷帕霉素作用于非小細(xì)胞肺癌LK2細(xì)胞后其中的microRNA的表達(dá)變化,并將其中表達(dá)有顯著差異改變的microRNA進(jìn)行靶基因預(yù)測,將與細(xì)胞增殖和凋亡相關(guān)的基因篩選出來進(jìn)行靶基因預(yù)測。
結(jié)果:
與對照組相比,Illumina HiSeqTM 2500 miRNA測序顯示,雷帕霉素作用于非小細(xì)胞肺癌LK2細(xì)胞后microRNA的表達(dá)
3、有變化。實驗中我們能夠發(fā)現(xiàn)有9個microRNAs表達(dá)具有高顯著差異,其中miR-320c,miR-1283,miR-29b-3p,miR-181c-5p,miR-24-3p,miR-26a-5p的表達(dá)顯著增強。而miR-320b,miR-19b-3p,miR-181c-6p表達(dá)明顯降低。通過預(yù)測了上述microRNA的與細(xì)胞增殖及凋亡相關(guān)靶基因,得到例如有PAX3,HMGB2等靶基因。
結(jié)論:
雷帕霉素作用于非小細(xì)
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