開(kāi)發(fā)中國(guó)人藥物基因組信息庫(kù)及觀察早期腎移植術(shù)后病人CYP3A和ABCB1基因多態(tài)對(duì)環(huán)孢素A藥代動(dòng)力學(xué)的影響.pdf

1、自從人類(lèi)基因組計(jì)劃實(shí)施以來(lái)，生物信息學(xué)得到了迅猛發(fā)展。它主要是利用數(shù)學(xué)、信息學(xué)、統(tǒng)計(jì)學(xué)、計(jì)算機(jī)等學(xué)科來(lái)研究生物學(xué)的問(wèn)題，是分子生物學(xué)與信息技術(shù)（尤其是互聯(lián)網(wǎng)技術(shù)）的結(jié)合體。其研究材料是基于計(jì)算機(jī)的海量生物學(xué)數(shù)據(jù)，其方法就是對(duì)生物學(xué)數(shù)據(jù)的收集、篩選、編輯、整理、管理、顯示、計(jì)算及模擬。
　　生物信息學(xué)極大的影響了基因組學(xué)的一個(gè)分支學(xué)科——藥物基因組學(xué)。在它的影響下，藥物基因組學(xué)以前所未有的速度發(fā)展。然而，藥物基因組學(xué)研究所產(chǎn)生的試驗(yàn)

2、數(shù)據(jù)大多是分散和無(wú)結(jié)構(gòu)化的，所以生物學(xué)家們要想獲取集中有序的數(shù)據(jù)異常艱難。如果建立各種便于訪問(wèn)的藥物基因組數(shù)據(jù)庫(kù)則可以有效的解決這一問(wèn)題。因此，我們研發(fā)了中國(guó)人藥物基因組信息庫(kù)(CPGxNet)。
　　此外，我們還進(jìn)行了一項(xiàng)關(guān)于早期腎移植術(shù)后病人CYP3A和ABCB1基因多態(tài)以及其組成的單倍型對(duì)環(huán)孢素A藥代動(dòng)力學(xué)影響的試驗(yàn)性研究。研究中，我們把CYP3A和ABCB1的分型結(jié)果用一種試探性的推測(cè)方法順次和來(lái)自Web of Scien

3、ce、CPGxNet數(shù)據(jù)庫(kù)中的相關(guān)數(shù)據(jù)進(jìn)行了比較分析，以此來(lái)驗(yàn)證CPGxNet數(shù)據(jù)庫(kù)報(bào)表數(shù)據(jù)的可靠性。
　　本課題具體研究結(jié)果如下:
　　1、開(kāi)發(fā)了基于瀏覽器朋艮務(wù)器(B/S)架構(gòu)完全免費(fèi)的CPGxNet數(shù)據(jù)庫(kù)，并通過(guò)互聯(lián)網(wǎng)進(jìn)行正式發(fā)布（網(wǎng)址:http://www.cpgxnet.net/）;
　　2、CPGxNet數(shù)據(jù)庫(kù)目前共收錄5個(gè)基因，98個(gè)單核苷酸多態(tài)位點(diǎn)(SNP)，124種藥物，1145條中國(guó)人藥物相關(guān)基因突

4、變記錄，并還在持續(xù)收錄中;
　　3、本數(shù)據(jù)庫(kù)中國(guó)人樣本集信息以及由此的報(bào)表功能目前還未發(fā)現(xiàn)類(lèi)似藥物基因組數(shù)據(jù)庫(kù)涉及，經(jīng)分析驗(yàn)證可以認(rèn)為這一模塊對(duì)研究人員具有一定的參考價(jià)值，即可以幫助科研人員弄清楚當(dāng)前藥物基因組學(xué)在中國(guó)人方面的研究熱點(diǎn)，比如涉及的種族、地域、大小、頻率、表型、研究時(shí)間等;
　　4、我們把試驗(yàn)分型數(shù)據(jù)（CYP3A4*1G、CYP3A5*3C、ABCB11236C＞T、2677G＞T/A和3435C＞T的突變頻率

5、分別為26.2％、69％、65.5％、42.5％/14.3％和38.9％）和來(lái)自Web of Science、CPGxNet數(shù)據(jù)庫(kù)的相關(guān)結(jié)果進(jìn)行比較，驗(yàn)證了CPGxNet數(shù)據(jù)庫(kù)生成報(bào)表數(shù)據(jù)的可靠性，提示了CPGxNet數(shù)據(jù)庫(kù)具有一定的參考價(jià)值;
　　5、我們把對(duì)數(shù)據(jù)庫(kù)驗(yàn)證的分型數(shù)據(jù)通過(guò)單基因分析，進(jìn)一步觀察到CYP3A5*3C多態(tài)性與CYP3A5-CYP3A5 AA單倍型和早期腎移植病人服用CsA的藥代動(dòng)力學(xué)具有相關(guān)性（P＜0.0

6、5），而未發(fā)現(xiàn)CYP3A4*1G、ABCB11236C＞T、ABCB12677G＞T/A和ABCB13435C＞T多態(tài)性以及CYP3A4-CYP3A5 GG、ABCB11236-2677-3435TTT、CGC和TGC單倍型和病人的CsA藥代動(dòng)力學(xué)有相關(guān)性(P＞0.05);
　　6、我們?yōu)榱舜_定CYP3A5*3C是否作為獨(dú)立因素影響藥物CsA的藥代動(dòng)力學(xué)，我們以CYP3A5*3C、年齡、血紅蛋白、血尿素氮和血肌酐為自變量構(gòu)建的多元