利用SNP標記在中國荷斯坦牛中精細定位BTA6上產(chǎn)奶性狀QTLs.pdf

1、多項研究已表明BTA6上存在產(chǎn)奶性狀QTLs。Chen(2005)在基于女兒設計的中國荷斯坦牛群中也檢測到產(chǎn)奶性狀QTLs，并將影響產(chǎn)奶量、乳脂量和乳蛋白量的QTLs定位在標記BMS470附近，BMS1242附近也有一個影響乳脂量的QTL。本研究綜合目前國內(nèi)外研究進展，借助最新公布的奶?；蚪M序列圖和遺傳圖譜選定了BTA6上熱點研究區(qū)域內(nèi)相對較小的區(qū)段(標記BMS2508-ILSTS097之間)作為目標QTL精細定位區(qū)段，利用高密度SN

2、P標記在中國荷斯坦牛中對產(chǎn)奶性狀QTLs進行了精細定位研究。 1．通過對公?；蚪MDNA的目標區(qū)段進行逐段PCR擴增和PCR產(chǎn)物直接測序方法獲得了新的SNP標記，共得到32個新標記。為增加標記密度，綜合利用NCBI上已公布的目標區(qū)段內(nèi)SNP標記和本研究的新標記，在25Mbp的范圍內(nèi)共選用了15個SNP標記。采用RFLP、TaqMan探針及AFLP對來自11個公牛半同胞家系的1449個中國荷斯坦牛個體的標記基因型進行了檢測判定。

3、 2．通過LOKI多點連鎖分析，在標記FAM13A1-PPARGClA-SLC34A2處檢測到305天產(chǎn)奶量QTL，且BF值在PPARGClA處達最大(BF=40.25)；在多個不同家系組合群體中檢測到標記OPN處存在影響產(chǎn)奶量的QTL在標記CR-CEPl35之間以及標記M和STIM2之間也存在產(chǎn)奶量QTLs。對乳蛋白量的分析結(jié)果顯示，標記PPMlK-FAM13A1和PPARGClA-SLC34A2處分別存在一個乳蛋白量QTL。乳

4、脂量的QTLs被定位在標記STIM2-MBIP和標記UGDH-CR之間。在本研究群體中未檢測到乳成分QTL。 3．關(guān)聯(lián)分析結(jié)果顯示，標記FAM13A1、PPARGClA、SLC34A2、OPN、CR、CEP135、M、STIM2、PPMlK、MBIP、UGDH分別對產(chǎn)奶量，乳脂量，乳蛋白量有極顯著影響(p<0.01)。在最新的?；蚪M序列圖中，這些區(qū)段內(nèi)除了標記STIM2-MBIP和CR-CEP135之間有相對大一些的gap以外