中國荷斯坦牛PL和α-LA多態(tài)性、RH定位及其與產(chǎn)奶性狀關(guān)聯(lián)分析.pdf

1、在奶牛育種中標記輔助選擇可以對公牛進行預(yù)選擇，并且可以提高奶牛低遺傳力性狀和記錄困難性狀的育種值估計準確性以提高奶牛的遺傳進展。本研究應(yīng)用PCR-SSCP方法，在1028頭中國荷斯坦牛群體中，分析了牛胎盤催乳素基因(bPL)和α-乳清白蛋白基因(α-LA)的分子遺傳多態(tài)性及其與5個產(chǎn)奶性狀之間的關(guān)聯(lián)，旨在探索將其作為遺傳標記應(yīng)用于奶牛標記輔助選擇的可行性。 在bPL基因的外顯子2和4上分別發(fā)現(xiàn)一個單核苷酸多態(tài)位點，命名為bPL2

2、和bPL4。序列分析發(fā)現(xiàn)bPL2位點突變是由T→C的錯義突變，該突變導(dǎo)致第37位的氨基酸殘基由纈氨酸(Val)→丙氨酸(Ala)；bPL4位點的突變?yōu)镚→A同義突變。在α-LA基因上共發(fā)現(xiàn)兩個單核苷酸多態(tài)位點，分別位于5’側(cè)翼區(qū)和內(nèi)含子3；命名為α-LA(+15)和α-LA(13)。α-LA(+15)位點為G→A突變，α-LA(13)為T→C突變。 卡方檢驗結(jié)果表明bPL2、bPL4和α-LA(13)等三個位點均顯著偏離哈迪．溫

3、伯格平衡狀態(tài)(P<0.001，P<0.001和P<0.001)，α-LA(+15)位點處于哈迪溫伯格平衡狀態(tài)(P>0.05)。 應(yīng)用PEST軟件，構(gòu)建混合動物模型，對四個位點不同基因型在5個產(chǎn)奶性狀的遺傳效應(yīng)之間的差異、顯性效應(yīng)和加性效應(yīng)進行了顯著性檢驗。結(jié)果表明：在bPL2位點上，AA基因型個體的產(chǎn)奶量和乳蛋白量顯著低于BB基因型個體(P=0.001和P=0.003)和AB基因型個體(P=0.005和P=0.005)。該位點在

4、產(chǎn)奶量和乳蛋白量兩個性狀上的加性效應(yīng)達到顯著水平(P=0.001和P=0.003)，顯性效應(yīng)不顯著(P=0.136和P=0.092)。 在bPL4位點上，BB基因型個體的乳脂量高于AA和AB基因型個體(P=0.032和P=0.036)：在乳脂率、乳蛋白率、產(chǎn)奶量和乳蛋白量等4個產(chǎn)奶性狀的遺傳效應(yīng)之間均未達到顯著水平(P=0.087～0.903)；顯性效應(yīng)和加性效應(yīng)上也不顯著(P=0.092～0.801)。 在α-LA(+

5、15)和α-LA (13)兩個位點上，其不同基因型對5個產(chǎn)奶性狀的遺傳效應(yīng)之間顯著水平為P=0.034～0.933。 利用SignalP(V.2.0)和GCG(V.11.1)軟件包對37A和37V進行蛋白質(zhì)二級結(jié)構(gòu)預(yù)測，發(fā)現(xiàn)親水性、表面系數(shù)、鏈彈性系數(shù)、GOR結(jié)構(gòu)和抗原指數(shù)等指標在蛋白信號肽部分存在較為明顯的差異。其中在第37氨基酸殘基位點使得37A比37V在親水性、表面系數(shù)、鏈彈性系數(shù)和抗原指數(shù)等指標上分別高0.343、0.4

6、78、0.015和0.4。 輻射雜交定位(RH mapping)分析將bPL基岡定位丁牛第23號染色體，與標記CC549051和RM185緊密連鎖(LOD=8.2，圖距=23.2cR)。α-LA基因定位于牛第5號染色體，與標記U63110、 CC537786和L10347緊密連鎖(LOD=8.37、8.33利8.93，圖距=27.6、30.2和26.1 cR)。 以上研究結(jié)果提示：bPL基因外顯子2的突變，bPL2，與產(chǎn)