大鼠肝癌模型的蛋白質(zhì)組學(xué)和基因表達(dá)譜研究.pdf

1、肝細(xì)胞癌(hepatocellularcarcinoma，HCC)是最常見的惡性腫瘤。利用使用化學(xué)誘導(dǎo)劑二乙基亞硝胺(DEN)建立的大鼠原發(fā)性肝癌模型研究肝細(xì)胞癌可能的發(fā)生機(jī)制。取大鼠肝癌及正常肝組織各取三個(gè)樣品，分別從蛋白質(zhì)組學(xué)和基因表達(dá)譜技術(shù)兩方面分析樣品。蛋白組學(xué)技術(shù)利用2D-DIGE和MALID-TOF-MS技術(shù)?；虮磉_(dá)譜使用安捷倫最新的大鼠44K基因組芯片進(jìn)行分析。結(jié)果：蛋白質(zhì)組學(xué)：利用2D-DIGE和MALID-TOF-M

2、S蛋白組學(xué)技術(shù)我們分析了18個(gè)蛋白差異點(diǎn)，這些點(diǎn)可以對(duì)應(yīng)到由DEN誘導(dǎo)的大鼠肝癌模型的差異表達(dá)蛋白中。在這些腫瘤相關(guān)蛋白中，明顯上調(diào)的蛋白包括GST超家族，醛-酮還原酶超家族和缺氧應(yīng)激相關(guān)蛋白的相應(yīng)成員。下調(diào)的蛋白有延胡索酰乙酰乙酸酶，在肝癌中都有報(bào)道和3-氧-5-B類固醇-4乳酸脫氫酶，它的缺失可造成肝功能紊亂。另外，在大鼠肝癌組織發(fā)現(xiàn)dermcidin，一種汗腺特異性蛋白有明顯上調(diào)。通過western和免疫組化進(jìn)一步證明了蛋白組學(xué)的

3、結(jié)論。相對(duì)應(yīng)的樣品通過aligent芯片分析。通過生物信息學(xué)進(jìn)行聚類及功能分類分析結(jié)果顯示，有789個(gè)基因顯著上調(diào)，559個(gè)基因顯著下調(diào)，這些顯著變化的基因主要與細(xì)胞周期、細(xì)胞浸潤(rùn)及轉(zhuǎn)移、細(xì)胞信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)及細(xì)胞代謝等密切相關(guān)。這些基因可能是使用化學(xué)誘導(dǎo)劑產(chǎn)生的肝癌的標(biāo)志物，在腫瘤的早期診斷、尋找藥物作用靶點(diǎn)、預(yù)后判斷、監(jiān)測(cè)及個(gè)體化治療中起重要作用?；瘜W(xué)誘導(dǎo)劑產(chǎn)生的肝癌模型與人肝癌有著相似性，所以這些數(shù)據(jù)對(duì)研究肝細(xì)胞癌的機(jī)制有重要意義。研究結(jié)