水稻OsSZF1基因的克隆與其功能初步分析.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、本文選用粳型旱稻品種“滬旱3號”為模式材料,在本研究室對抗旱QTt。定位的基礎(chǔ)上,采用RT-PCR策略,從抗旱QTL區(qū)間克隆水稻逆境脅迫相關(guān)基因,并進(jìn)行功能驗證。 通過SMART RACE技術(shù),從EST片段的保守區(qū),分別獲得OsSZFl基因的3’和5’端序列,利用Vector NTI 8.0將保守區(qū)、3’和5’拼接后得到OsSZF1基因全長cDNA。通過相關(guān)的生物信息分析,獲得一個開放閱讀框,編碼367個氨基酸,3’端有210b

2、p的非翻譯區(qū),5’端也有182bp的非翻譯區(qū),具有保守的C3HC4結(jié)構(gòu),是典型的RING型鋅指蛋白基因。 通過RT-PCR技術(shù),擴(kuò)增水稻OsSZF1基因開放閱讀框, Southern雜交分析表明OsSZF1基因在水稻基因組中為單拷貝。分別用3種不同濃度梯度的NaCl、脫落酸(ABA)、水楊酸(SA)和甘露醇(Mannitol)和甲基茉莉酸(m-JA)處理水稻幼苗1 h后剪取葉片和根,抽提總RNA反轉(zhuǎn)錄成cDNA為模板,以3’非編

3、碼區(qū)設(shè)計引物,使用熒光定量PCR檢測OsSZF1基因在不同處理的表達(dá)情況,結(jié)果顯示OsSZF1基因受不同處理誘導(dǎo)表達(dá),以ABA,NaCl的表達(dá)差異最大,水楊酸和甲基茉莉酸低濃度處理就可誘導(dǎo)OsSZF1基因表達(dá),但隨著處理濃度的升高表達(dá)反而下降,不同濃度甘露醇處理后,OsSZF1基因的表達(dá)量隨著濃度的增加而增加,由此表明水稻OsSZFl基因和植物的抗逆性有關(guān)系,且該基因?qū)Σ煌瑵舛鹊奶幚碛胁煌膽?yīng)答,是ABA依賴的DNA表達(dá)蛋白。

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