南海鳶烏賊的種群遺傳結(jié)構(gòu).pdf

1、鳶烏賊由于生物量巨大、對(duì)捕撈壓力的耐受性強(qiáng)，被認(rèn)為是南海大洋性漁業(yè)資源中最具開(kāi)發(fā)潛力的種類。
　　目前南海鳶烏賊的基礎(chǔ)生物學(xué)信息仍非常缺乏，尤其是其種群遺傳結(jié)構(gòu)信息的缺失，給“管理單元?jiǎng)澐帧钡萨S烏賊資源開(kāi)發(fā)措施的制定帶來(lái)了很大的困難。
　　因此，本研究選用微衛(wèi)星分子標(biāo)記，在南海采集鳶烏賊地理群體樣品，對(duì)南海鳶烏賊的種群結(jié)構(gòu)進(jìn)行了細(xì)致的分析。
　　本研究主要包括兩部分內(nèi)容：鳶烏賊微衛(wèi)星標(biāo)記的開(kāi)發(fā)和南海鳶烏賊的種群遺傳結(jié)構(gòu)

2、分析。
　　（1）鳶烏賊微衛(wèi)星標(biāo)記的開(kāi)發(fā)
　　首先通過(guò)“磁珠富集法”構(gòu)建南海鳶烏賊的微衛(wèi)星片段富集文庫(kù)，經(jīng)過(guò)篩選獲得200個(gè)含有微衛(wèi)星片段的陽(yáng)性克隆子。對(duì)其測(cè)序后設(shè)計(jì)出153對(duì)引物。然后，使用一個(gè)采自南海美濟(jì)礁附近海域的鳶烏賊群體（樣本量48）對(duì)上述引物進(jìn)行篩選。最終獲得擴(kuò)增穩(wěn)定性好、特異性強(qiáng)且多態(tài)性豐富的21個(gè)微衛(wèi)星標(biāo)記。其等位基因數(shù)的分布范圍為6-32，平均值為15.952；表觀雜合度的分布范圍為0.188-0.890，

3、平均值為0.666；期望雜合度的分布范圍為0.322-0.964，平均為0.830；全部標(biāo)記無(wú)連鎖不平衡現(xiàn)象存在，有5個(gè)標(biāo)記背離“哈迪—溫伯格”平衡，4個(gè)標(biāo)記可能含有零等位基因。
　?。?）南海鳶烏賊的種群遺傳結(jié)構(gòu)分析
　　從上述標(biāo)記中篩選出遺傳屬性優(yōu)秀的12個(gè)微衛(wèi)星標(biāo)記，對(duì)南海鳶烏賊6個(gè)地理群體進(jìn)行等位基因分型，以獲取南海鳶烏賊的遺傳多樣性信息。其結(jié)果是，在6個(gè)不同地理群體中總共檢測(cè)出181個(gè)等位基因，微衛(wèi)星標(biāo)記的等位基因

4、平均數(shù)值為15.08，分布范圍為5-22；在所有“群體—標(biāo)記”組合中，表觀雜合度的分布范圍為0.354-0.875；期望雜合度的分布范圍為0.401-0.946；各群體平均表觀雜合度的分布范圍為0.652（南沙群島中部）-0.698（南沙群島南部）；期望雜合度的分布范圍為0.769（南沙群島中部）-0.846（南沙群島南部）；在總共69個(gè)“群體—標(biāo)記”組合中，在經(jīng)過(guò)“Sequential Bonferroni”校正后，有3個(gè)組合背離“哈

5、迪—溫伯格”平衡（校正P值≤0.00417）。
　　對(duì)南海鳶烏賊的種群遺傳結(jié)構(gòu)進(jìn)行分析，遺傳分歧分析結(jié)果表明，絕大部分的遺傳差異（99.61％）位于地理群體內(nèi)部，僅有少量（0.39%）位于地理群體間，整體固定指數(shù)（Overall FST）為0.391。多維尺度分析結(jié)果顯示，6個(gè)地理群體在2維圖上分布比較分散且地理群體間無(wú)聚類現(xiàn)象，表明6個(gè)地理群體間的遺傳距離與實(shí)際地理無(wú)明顯關(guān)系。地理距離隔離檢測(cè)結(jié)果表明，南海鳶烏賊群體對(duì)間遺傳關(guān)系

6、與地理距離間不存在顯著的相關(guān)性（r=0.0696，P=0.605）。個(gè)體分配分析表明，種群數(shù)K設(shè)定為2時(shí)，中沙群島東部群體中80.8%的個(gè)體被分配到假設(shè)種群1，在南沙群島南部群體中75.9%的個(gè)體被分配到假設(shè)種群2。其余四個(gè)種群的個(gè)體在假設(shè)種群1和假設(shè)種群2中分配比例比較均衡，當(dāng)種群數(shù)K設(shè)定為3時(shí)，各地理群體的個(gè)體在3個(gè)假定種群中的分布比較均勻，未能明確地闡明南海鳶烏賊的種群分布狀況。從整體上看，在南海海域范圍內(nèi)存在著兩個(gè)鳶烏賊種群，這