全球大青鯊種群遺傳結(jié)構(gòu)的初步研究.pdf

1、大青鯊(Prionace glauca)是金槍魚延繩釣的主要兼捕對(duì)象，是目前世界上被捕殺最多的鯊魚品種之一，并在海洋生態(tài)系統(tǒng)中處于重要地位，開展大青鯊種群遺傳結(jié)構(gòu)的研究有助于人們更好的理解大青鯊的資源狀況，維持大青鯊資源的可持續(xù)發(fā)展。本文根據(jù)2010年9月-2012年2月我國(guó)遠(yuǎn)洋捕撈船外海作業(yè)期間在赤道附近海域采集的大青鯊樣本，利用線粒體DNA的D-loop區(qū)（控制區(qū)）和COI基因的部分序列為分子標(biāo)記來研究其種群遺傳結(jié)構(gòu)和遺傳多樣性，主

2、要結(jié)果如下：
　?。?）利用線粒體DNA的D-loop區(qū)（控制區(qū)）的694bp部分序列，分析了來自中東太平洋、中西太平洋、中東大西洋、西南大西洋和印度洋5個(gè)海域的165個(gè)個(gè)體的序列多樣性與種群遺傳結(jié)構(gòu)。結(jié)果顯示：測(cè)定165尾大青鯊mtDNA控制區(qū)片段長(zhǎng)為694bp，共得到110個(gè)變異位點(diǎn)，定義了145個(gè)單倍型，堿基組成為A：33.46％，T：36.40%，C：18.61%，G：11.53%，G+C含量為30.14%。單倍型多樣性指

3、數(shù)（Hd）在各個(gè)采樣點(diǎn)都較高，平均值為0.9973±0.0014，核苷酸多樣性指數(shù)（π）為0.01510±0.00091，這表明大青鯊群體的遺傳多樣性很高，遺傳資源豐富。分子方差分析揭示99.28%的遺傳變異性出現(xiàn)在種群內(nèi)，0.72%的遺傳變異來自于種群間；采用鄰接法構(gòu)建的系統(tǒng)發(fā)育樹表明5個(gè)群體間未形成顯著的遺傳結(jié)構(gòu)，群體間的高基因交流值Nm和低分化指數(shù)Fst揭示三大洋群體間基因交流頻繁，不存在顯著的遺傳分化，遺傳多樣性較高。
　

4、?。?）對(duì)全球8個(gè)采樣位點(diǎn)的242尾大青鯊線粒體DNA的細(xì)胞色素氧化酶亞基I(COI)基因的721bp的部分序列進(jìn)行檢測(cè)，結(jié)果顯示：721bp片段中發(fā)現(xiàn)了22個(gè)多態(tài)性變異位點(diǎn)，242個(gè)個(gè)體定義了21個(gè)單倍型。堿基組成為T：36.42%，C：20.72%，A:26.91%，G：15.95%。序列多樣性分析結(jié)果顯示，242個(gè)個(gè)體的平均單倍型多樣性指數(shù)為0.644，核苷酸多樣性指數(shù)為0.00123。分子方差分析揭示，96.07%的遺傳變異性出

5、現(xiàn)在種群內(nèi)，3.93%的遺傳變異來自于種群間；基于COI單倍型構(gòu)建的系統(tǒng)進(jìn)化樹和單倍型網(wǎng)絡(luò)揭示三大洋的8個(gè)群體間未形成顯著的遺傳結(jié)構(gòu)，群體間的高基因交流值Nm和低分化指數(shù)Fst揭示三大洋群體間基因交流頻繁，不存在顯著的遺傳分化；核苷酸錯(cuò)配分布呈明顯的單峰分布，暗示大青鯊在近期經(jīng)歷了群體擴(kuò)張事件，Tajima’s D和Fu’s Fs中性檢驗(yàn)表明擴(kuò)張過程中群體顯著偏離中性。
　?。?）線粒體DNA控制區(qū)（D-loop區(qū)）的多態(tài)性分析結(jié)