赤點(diǎn)石斑魚種群遺傳多樣性研究.pdf

1、赤點(diǎn)石斑魚是我國重要的經(jīng)濟(jì)魚類和養(yǎng)殖的重要種類，由于過度捕撈和生境變化，資源量嚴(yán)重衰竭，加之其獨(dú)特的生殖習(xí)性，其種質(zhì)資源現(xiàn)狀及其可持續(xù)利用前景令人堪憂。本研究以我國東海、南海的赤點(diǎn)石斑魚野生群體為研究對(duì)象，采用多種分子標(biāo)記技術(shù)對(duì)其群體遺傳多樣性和遺傳結(jié)構(gòu)進(jìn)行了研究，以闡述其種質(zhì)資源現(xiàn)狀，為赤點(diǎn)石斑魚遺傳育種和漁業(yè)管理提供理論依據(jù)。 本研究共采集了我國東海和南海的赤點(diǎn)石斑魚7個(gè)地理群體共88個(gè)個(gè)體，采用了線粒體DNA控制區(qū)、AFL

2、P和微衛(wèi)星三種分子標(biāo)記研究赤點(diǎn)石斑魚的群體遺傳結(jié)構(gòu)和群體遺傳多樣性。 1.對(duì)赤點(diǎn)石斑魚控制區(qū)部分序列進(jìn)行分析。赤點(diǎn)石斑魚群體的單倍型多態(tài)很高，采用中性檢驗(yàn)和核苷酸不配對(duì)分布分析了赤點(diǎn)石斑魚的群體歷史動(dòng)態(tài)，分子方差分析和Fst的結(jié)果顯示赤點(diǎn)石斑魚在分布區(qū)內(nèi)存在顯著的種群遺傳結(jié)構(gòu)。 2.利用13對(duì)選擇性引物對(duì)赤點(diǎn)石斑魚群體遺傳變異進(jìn)行了AFLP分析，13對(duì)引物在7個(gè)群體中擴(kuò)增出941個(gè)條帶，7個(gè)群體的多態(tài)位點(diǎn)比例為18.40

3、％～47.70％，Nei遺傳多樣性指數(shù)為0.0447～0.1429，Shannon多樣性指數(shù)為0.0665～0.2141；分子方差分析和Fst的結(jié)果群體間遺傳差異顯著；檢測(cè)到多條種群間特異性條帶，可以作為種群鑒別的標(biāo)志。 3.利用赤點(diǎn)石斑魚的近緣種微衛(wèi)星序列篩選建立了適合赤點(diǎn)石斑魚的微衛(wèi)星體系，研究了赤點(diǎn)石斑魚群體在7個(gè)微衛(wèi)星位點(diǎn)上的變異情況，在7個(gè)基因位點(diǎn)上共檢測(cè)到45個(gè)等位基因，每個(gè)引物擴(kuò)增出4～11個(gè)等位基因，平均每個(gè)引物

4、獲得6.4個(gè)等位基因，7個(gè)群體的觀測(cè)雜合度(Ho)在0.2190～0.5079之間，預(yù)期雜合度(He)在0.3683～0.6689之間；7個(gè)群體間的遺傳距離在0.0665～0.7093之間，兩兩群體間的Fst值在0.0048～0.2558之間，大部分群體間遺傳差異顯著。 線粒體DAN控制區(qū)、AFLP和微衛(wèi)星結(jié)果表明赤點(diǎn)石斑魚不同地理群體間存在不同程度分化，可劃分為兩個(gè)獨(dú)立地理種群，三亞和湛江群體為一地理種群，其余群體為一個(gè)地理種