大鼠肝再生中高表達(dá)lncRNA調(diào)節(jié)肝細(xì)胞增殖的途徑和方式研究.pdf

1、本研究采用高通量測(cè)序方法檢測(cè)大鼠2/3肝切除誘導(dǎo)的肝再生10個(gè)時(shí)間點(diǎn)肝細(xì)胞中表達(dá)的lncRNA，根據(jù)表達(dá)豐度篩選出高表達(dá)lncRNA。結(jié)果表明，大鼠肝再生10個(gè)時(shí)間點(diǎn)肝細(xì)胞中共表達(dá)11389個(gè)lncRNA，其中，130個(gè)lncRNA的表達(dá)豐度在100以上，為高表達(dá)lncRNA。
　　為了解這些高表達(dá)lncRNA對(duì)肝再生的調(diào)節(jié)作用，采用生物信息學(xué)方法預(yù)測(cè)其靶基因，結(jié)果表明，130個(gè)高表達(dá)lncRNA有1314個(gè)靶基因。從靶基因角度出

2、發(fā)，為進(jìn)一步篩選出待研究的lncRNA及其在肝再生中的作用，用Rat Genome2302.0基因芯片檢測(cè)上述1314個(gè)高表達(dá)lncRNA靶基因在大鼠肝再生10個(gè)時(shí)間點(diǎn)肝細(xì)胞中的表達(dá)譜。結(jié)果表明，有751個(gè)靶基因被檢測(cè)到，其中243個(gè)發(fā)生了有意義表達(dá)變化，包括175個(gè)有意義上調(diào)靶基因，66個(gè)有意義下調(diào)靶基因，2個(gè)上/下調(diào)靶基因。分析這243個(gè)高表達(dá)lncRNA有意義靶基因參與的生理活動(dòng)表明，其中238個(gè)靶基因功能已知，主要參與應(yīng)激反應(yīng)、

3、發(fā)育過(guò)程、細(xì)胞通訊、信號(hào)傳導(dǎo)、核酸代謝、器官發(fā)育、分子運(yùn)輸、細(xì)胞增殖和細(xì)胞分化等生理活動(dòng)，其中，參與細(xì)胞增殖的有意義靶基因有68個(gè)。
　　本文選取細(xì)胞增殖活動(dòng)進(jìn)一步研究高表達(dá)lncRNA通過(guò)其有意義靶基因調(diào)節(jié)肝再生的途徑和方式。根據(jù)本研究組已建立的方法確認(rèn)上述243個(gè)高表達(dá)lncRNA有意義靶基因參與的信號(hào)通路，結(jié)果表明，它們共參與15條細(xì)胞增殖相關(guān)信號(hào)通路。用譜函數(shù)Ep(t)分析這些信號(hào)通路的信號(hào)傳導(dǎo)活動(dòng)表明，其中的6條通路在肝

4、再生的起始和/或進(jìn)展階段被激活，分別為Growth Hormone通路、NF-κB通路、PI3K/AKT通路、HGF通路、IL-6通路和cAMP通路。進(jìn)一步分析上述68個(gè)細(xì)胞增殖靶基因的協(xié)同作用表明，它們所支配的細(xì)胞增殖活動(dòng)在肝再生的進(jìn)展階段被激活，說(shuō)明高表達(dá)lncRNA有意義靶基因所支配的細(xì)胞增殖信號(hào)通路的信號(hào)傳導(dǎo)活動(dòng)與高表達(dá)lncRNA有意義靶基因所支配的細(xì)胞增殖活動(dòng)呈正相關(guān)。
　　以上結(jié)果說(shuō)明，由高表達(dá)lncRNA有意義靶基