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文檔簡(jiǎn)介
1、第一部分、建立早期糖尿病腎病循環(huán)miRNA指紋譜
目的:建立早期糖尿病腎病(Diabetic nephropathy,DN)循環(huán)microRNA(miRNA)指紋譜,為糖尿病腎病的早期分子診斷和治療提供依據(jù)。
方法:使用PAXgeneTM blood RNA tubes采集早期糖尿病腎病和糖尿病(Diabetes mellitus,DM)患者的新鮮血液各3例,Trizol法提取總RNA,YM-100微離心過(guò)濾柱富集片
2、段小于300 nt的小RNA,經(jīng)過(guò)修飾處理后與含有最新版本探針序列(Version10.0 microRNA數(shù)據(jù)庫(kù),http://microrna.sanger.ac.uk/sequences/)的RNA芯片雜交和特異性的熒光染料染色,經(jīng)過(guò)軟件分析和數(shù)據(jù)處理后,獲得早期糖尿病腎病和糖尿病的差異表達(dá)譜。通過(guò)TaqMan(@)MicroRNA Assays定量RT-PCR試劑盒對(duì)6個(gè)樣本中的let-7a的表達(dá)水平進(jìn)行定量檢測(cè),驗(yàn)證RNA芯片
3、結(jié)果的可靠性。
結(jié)果:RNA芯片檢測(cè)結(jié)果顯示早期糖尿病腎病和糖尿病血液中的miRNA有22個(gè)差異表達(dá)較明顯的,通過(guò)比較共篩選出10個(gè)糖尿病腎病顯著差異miRNAs,其中表達(dá)上調(diào)的miRNAs為5個(gè),分別是hsa-miR-4429、 hsa-miR-4454、 hsa-miR-320e、 hsa-miR-320b和hsa-miR-320d,表達(dá)下調(diào)的miRNAs為5個(gè),分別是hsa-let-7f、hsa-miR-363、hsa-
4、let-7a、hsa-let-7d、hsa-miR-26a。通過(guò)定量RT-PCR檢測(cè)了let-7a的表達(dá)水平,結(jié)果與芯片結(jié)果一致,表明芯片結(jié)果是可靠的。
結(jié)論:早期糖尿病腎病和糖尿病患者的部分循環(huán)miRNAs表達(dá)具有顯著差異,建立早期糖尿病腎病循環(huán)miRNA指紋譜可能為糖尿病腎病的早期分子診斷和治療提供新的思路。
第二部分、let-7a-3基因啟動(dòng)子甲基化對(duì)早期糖尿病腎病的調(diào)控作用
目的:檢測(cè)早期糖尿病腎病
5、(DN組)、糖尿?。―M組)和正常人(CON組)全血DNA中l(wèi)et-7a-3基因啟動(dòng)子的甲基化水平,探討基因啟動(dòng)子甲基化對(duì)let-7a表達(dá)的影響,為研究調(diào)控早期糖尿病腎病的發(fā)生發(fā)展的分子機(jī)制提供新的線索。
方法:熒光定量甲基化特異性PCR(qMSP)檢測(cè)DN組、DM組和CON組全血DNA樣本各20例的let-7a-3基因啟動(dòng)子甲基化率,PCR產(chǎn)物采用瓊脂糖凝膠電泳和克隆測(cè)序的方法驗(yàn)證PCR反應(yīng)的準(zhǔn)確性。
結(jié)果:qMS
6、P法檢測(cè)let-7a-3基因啟動(dòng)子的甲基化水平,顯示DN組平均甲基化率為96.2%,DM組平均甲基化率為76.6%,正常組平均甲基化率為63.2%,經(jīng)統(tǒng)計(jì)分析,DN組平均甲基化率明顯高于DM組和正常組(P<0.05),而DM組和正常組相比,增高并不明顯(P>0.05)。
結(jié)論:早期糖尿病腎病患者let-7a-3基因啟動(dòng)子的甲基化水平明顯增高,影響let-7a-3基因的表達(dá),使得let-7a的表達(dá)量下降(RNA芯片和定量RT-P
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