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文檔簡(jiǎn)介
1、目的:
由茄科雷爾氏菌(Ralstonia solanacearum)感染番茄引起的青枯?。˙acterial wilt)是導(dǎo)致番茄減產(chǎn)的重要原因;組蛋白去乙酰化酶(Histone deacetylases,HDACs)主要參與植物的形態(tài)發(fā)育和應(yīng)對(duì)冷、干旱、抗病等外界脅迫過程;本論文通過生物信息學(xué)研究發(fā)現(xiàn)番茄含有15個(gè)HDACs,通過組織表達(dá)、氧化脅迫,及抗感病品種接種青枯菌條件下乙?;揎椬兓涂共arker基因ChIP-
2、QPCR分析,對(duì)組蛋白乙酰化參與番茄抗青枯病的機(jī)制進(jìn)行研究,為利用分子生物學(xué)技術(shù)和基因工程手段改良番茄青枯病抗性奠定堅(jiān)實(shí)的基礎(chǔ)。
方法:
利用生物信息學(xué)分析番茄組蛋白去乙酰化酶相關(guān)基因,并通過 GEO芯片分析以及Q-PCR驗(yàn)證番茄各個(gè)組織及脅迫處理?xiàng)l件下的表達(dá)差異。利用Western-blot分析抗感品種中組蛋白去乙?;富虻谋磉_(dá)差異、運(yùn)用ChIP和Q-PCR分析抗青枯病Marker基因的表達(dá)差異及 H3和H4乙酰
3、化修飾變化。構(gòu)建 pCanGmyc-SlHDT3和pYLRNAi5-35S-SlHDT3表達(dá)載體。通過篩選獲得最適的卡那霉素和潮霉素濃度,對(duì)番茄Henz1706遺傳轉(zhuǎn)化體系進(jìn)行優(yōu)化。在獲得轉(zhuǎn)基因植株后,利用普通PCR對(duì)番茄Henz1706基因組中外源基因新霉素磷酸轉(zhuǎn)移酶基因(NptⅡ)和潮霉素磷酸轉(zhuǎn)移酶(HPT)基因進(jìn)行檢測(cè)。
結(jié)果:
1.通過生物信息學(xué)分析得到15個(gè)番茄組蛋白去乙?;富颍嬖诮M織表達(dá)差異且受氧化
4、脅迫和青枯病響應(yīng)。
2.在接種青枯菌條件下,SlHDA6、SlHDA9和SlHDA10在抗病品種中上調(diào)表達(dá),感病品種下調(diào)表達(dá);SlHDA8、SlHDT1、SlHDT3和SlHSRT1在抗病品種中下調(diào)表達(dá),感病品種上調(diào)表達(dá);其它基因在抗感品種均上調(diào)表達(dá)。
3.在接種青枯菌條件下,ERF、WRKY等轉(zhuǎn)錄因子和激素通路Marker基因在抗病品種上調(diào)表達(dá),感病品種下調(diào)表達(dá);其中轉(zhuǎn)錄因子SlCBF1、SlPti5、SlWRKY
5、39、SlWRKY80表達(dá)差異最大。
4.轉(zhuǎn)錄因子ERF,如SlCBF1、SlPti5等乙酰化水平(H3ac、H4ac)在抗病品種中增加且通過乙?;揎梾⑴c抗番茄青枯病的過程。
5.組蛋白去乙?;敢种苿═SA)處理可促使番茄感病品種的抗病性增加。
6. Henz1706番茄遺傳轉(zhuǎn)化體系中最適的卡那霉素和潮霉素篩選濃度:20 mg/L Kan和4 mg/L Hyg。
7.成功構(gòu)建pCanGmyc
6、-SlHDT3和pYLRNAi5-35S-SlHDT3表達(dá)載體;分別獲得pCanGmyc-SlHDT3和pYLRNAi5-35S-SlHDT3陽性轉(zhuǎn)化植株5株和6株。
結(jié)論:
本研究通過番茄組蛋白去乙?;赶嚓P(guān)基因的生物信息學(xué)和氧化脅迫分析,闡明番茄組蛋白去乙?;赋蓡T組成及其在氧化脅迫中的關(guān)系;通過比較番茄抗病和感病品種間的組蛋白去乙?;虻牟町?、接種青枯菌條件下抗病 Marker基因的組蛋白修飾變化、以及 TS
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