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文檔簡介
1、PRRS是流行最廣的接觸性傳染病,給全世界的養(yǎng)豬業(yè)帶來巨大的經(jīng)濟損失。特別是2006年以來, HP-PRRSV肆虐中國養(yǎng)豬業(yè),給中國的養(yǎng)豬業(yè)帶來巨大的創(chuàng)傷。廣西是養(yǎng)豬大省,PRRSV是影響?zhàn)B豬業(yè)的主要病原之一,對PRRSV的防控至關(guān)重要。
(1)為了了解廣西PRRSV流行趨勢、基因遺傳變異規(guī)律,為該病的防控提供理論依據(jù)。本研究通過RT-PCR方法對2013-2014年采集的廣西地區(qū)各地市疑似PRRSV感染的475份樣品進行病原
2、檢測,陽性率為27.2%,說明廣西存在PRRSV流行;對檢測為PRRSV陽性的樣品在MARC-145細胞上進行病毒的分離鑒定,共分離獲得廣西PRRSV流行毒株65株。通過RT-PCR方法擴增、測序31株流行毒株的NSP2基因的高變區(qū)和58株流行毒株ORF5基因序列。31株P(guān)RRSV NSP2基因高變區(qū)序列核苷酸同源性為73.4~100%,推導(dǎo)編碼的氨基酸同源性為83.1~100%,與NCBI部分參考毒株的相應(yīng)核苷酸序列同源性為41.4~
3、99.5%,推導(dǎo)編碼氨基酸同源性為28.4~99.2%,NSP2普遍存在1+29個氨基酸缺失,缺失位置與高致病性毒株JXA1一致,GXYL1403d毒株的NSP2存在124個氨基酸缺失;NSP2基因高變區(qū)核苷酸遺傳進化分析表明31株P(guān)RRSV均與HP-PRRSV分布于同一分支上,表明31株P(guān)RRSV均為HP-PRRSV。58株流行毒株ORF5基因核苷酸之間同源性為86.4~100%,推導(dǎo)編碼的氨基酸同源性為84.5~100%,與NCBI
4、部分參考毒株的相應(yīng)核苷酸序列同源性為62.9~100%,推導(dǎo)編碼氨基酸同源性為56.6~100%,ORF5基因核苷酸遺傳進化分析表明58株P(guān)RRSV中,GXYL1403a和GXLB1403這兩株毒株與經(jīng)典毒株VR-2332分布于同一分支,GXGG1305a、GXGG1305b、GXGG1306與中間型毒株Em2007、HB-1/2(sh)-2002等分布于同一分支,其他的53株與HP-PRRSV分布于同一分支。序列分析和遺傳進化分析結(jié)果
5、說明了廣西流行多為高致病性PRRSV亞型毒株,但是經(jīng)典型和中間過渡型毒株仍有少量流行。
(2)對NSP2和GP5序列分析有特征性的4個毒株(GXYL1403d、GXGG1305a、GXGG1305b和GXGG1306)進行全基因測定、序列比較和遺傳進化。結(jié)果表明,GXGG1305a、GXGG1305b、GXGG1306這3株病毒全基因為15300nt,GXYL1403d為15018nt,4株病毒全基因組核苷酸同源性為96.3~
6、99.6%,與參考序列的同源性為60.7~98.1%。NSP2基因氨基酸序列比對結(jié)果表明GXYL1403d分別在481和511~635位缺失1個和123個氨基酸,這個位置的缺失是從未報道過的;GXGG1305a、GXGG1305b、GXGG1306缺失1+29個氨基酸,缺失位置與高致病性毒株JXA1一致。變異最大的GP5和GP3氨基酸比對結(jié)果表明,GXGG1305a、GXGG1305b、GXGG1306這三株病毒與JXA1相比,存在多個
7、氨基酸位點的突變。基于全長序列進行遺傳進化分析發(fā)現(xiàn)GXYL1403d分布于HP-PRRSV分支,GXGG1305a、GXGG1305b、GXGG1306分布于中間型。以上這些結(jié)果說明了中間型毒株與JXA1和CH-1a相比存在多處氨基酸位點突變。
(3)為研究分離的PRRSV毒株對高免血清的易感性、GP5氨基酸變異與中和抗體滴度差異相關(guān)性。本研究用抗JXM100毒株的免疫血清對2013-2014年廣西30株P(guān)RRSV分離株和1株
8、疫苗株進行中和抗體滴度差異性試驗。結(jié)果表明2013-2014年廣西的PRRSV流行株的中和抗體滴度高低不一,31株P(guān)RRSVs根據(jù)中和抗體滴度差異分為3個型,即敏感型(1∶16≤VN titers<1∶64之間)、中等抵抗型(1∶16<VN titers≤1∶8)和完全抵抗型(VNtiters<1∶8)。通過分析GP5氨基酸序列與中和抗體滴度差異性結(jié)果表明:GP5氨基酸同源性的高低與中和抗體滴度高低不存在直接的相關(guān)性。進一步比較GP5序
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