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1、第一部分 目的:研究HPV感染宮頸組織后蛋白質(zhì)組表達(dá)情況,初步探討高、低?;蛐透腥緦m頸組織后表達(dá)的差異,并對(duì)差異的蛋白點(diǎn)通過質(zhì)譜分析其意義。 方法:首先采用測(cè)序法及l(fā)uminex法對(duì)42例臨床HPV感染的標(biāo)本進(jìn)行高、低?;蚍中停殖蒆PV高?;蛐透腥緦m頸組織的CIN組,低?;蛐透腥緦m頸組織的CA組,每組篩選出3例標(biāo)本,打成混合池,與正常對(duì)照3例標(biāo)本混合池進(jìn)行雙向凝膠電泳,比較之間的差異,選取差異大的蛋白點(diǎn)
2、,進(jìn)行MALDI-TOF質(zhì)譜分析。 結(jié)果: 1.對(duì)HPV感染陽性的31例女性泌尿生殖道尖銳濕疣和11例宮頸CIN組織標(biāo)本,通過測(cè)序法和luminex法分型的結(jié)果為:(1)尖銳濕疣標(biāo)本(無論長(zhǎng)在什么部位)或CIN Ⅰ標(biāo)本,其HPV感染的基因型均為6、11等低危型,測(cè)序表現(xiàn)出的是單一峰型,而宮頸CIN Ⅱ~Ⅲ,其HPV感染的基因型均為16、18、33、58等高危型或高危型的混合感染,測(cè)序表現(xiàn)出的是單峰或雜峰;(2)外陰和宮頸
3、同時(shí)患有尖銳濕疣的標(biāo)本,其HPV感染的基因型是一致的。 2.將每組篩選的3例標(biāo)本打成混合池,并對(duì)宮頸尖銳濕疣、宮頸CIN及對(duì)照宮頸上皮組織蛋白質(zhì)組圖譜進(jìn)行兩兩比較,HPV低?;蛐透腥镜膶m頸尖銳濕疣組織標(biāo)本與正常宮頸組織標(biāo)本相比有63個(gè)蛋白質(zhì)點(diǎn)有顯著差異,其差異倍數(shù)最大的為20.2939,宮頸尖銳濕疣組表達(dá)上調(diào)的蛋白點(diǎn)有51個(gè),下調(diào)的有12個(gè)蛋白點(diǎn);HPV高?;蛐透腥镜膶m頸CIN組織標(biāo)本與正常宮頸組織標(biāo)本相比有47個(gè)蛋白質(zhì)點(diǎn)有
4、顯著差異,宮頸CIN表達(dá)上調(diào)的蛋白點(diǎn)有21個(gè),下調(diào)的有26個(gè)蛋白點(diǎn),上調(diào)倍數(shù)最大的為11.2506倍,下調(diào)倍數(shù)最大的為9.00021倍。HPV高?;蛐透腥镜膶m頸CIN組織標(biāo)本與低?;蛐透腥镜膶m頸尖銳濕疣組織標(biāo)本相比有39個(gè)蛋白質(zhì)點(diǎn)有顯著差異,宮頸CIN組較宮頸濕疣組表達(dá)上調(diào)的蛋白點(diǎn)有15個(gè),下調(diào)的有24個(gè)蛋白點(diǎn),上調(diào)倍數(shù)最大的為4.24857倍,下調(diào)倍數(shù)最大的為3.37334倍。 3.對(duì)3組26個(gè)差異蛋白質(zhì)點(diǎn)進(jìn)行分析,獲得了
5、22張肽質(zhì)量指紋圖,軟件識(shí)別其有效肽片段峰后查詢數(shù)據(jù)庫,搜索后得到匹配的有18個(gè)蛋白質(zhì)點(diǎn),并通過查詢NCBInr數(shù)據(jù)庫,獲得初步鑒定的18個(gè)蛋白質(zhì)的功能信息。它們主要與細(xì)胞代謝、信號(hào)傳導(dǎo)、細(xì)胞分泌、細(xì)胞骨架構(gòu)建及細(xì)胞增值、分化與凋亡等相關(guān)。結(jié)論本實(shí)驗(yàn)采用雙向凝膠電泳技術(shù)得到了HPV高、低危基因型感染宮頸組織和正常宮頸上皮組織的蛋白組表達(dá)圖譜,并找到兩者之間的差異蛋白點(diǎn)。通過質(zhì)譜分析及生物信息學(xué)技術(shù)鑒定了部分差異蛋白,其中一些可能與宮頸腫
6、瘤發(fā)生發(fā)展密切相關(guān)。為HPV感染宮頸組織的蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫的建立提供了有意義的資料。這些蛋白點(diǎn)能否作為診斷的標(biāo)記物和治療的靶標(biāo),值得進(jìn)一步研究。 第二部分 目的:探討HPV高、低?;蛐透腥緦m頸組織標(biāo)本比較蛋白質(zhì)組學(xué),找出差異的蛋白質(zhì)點(diǎn),鑒定與宮頸CA或?qū)m頸CIN發(fā)病相關(guān)的靶蛋白。 方法:應(yīng)用雙向凝膠電泳(2-DE)、質(zhì)譜分析和生物信息學(xué)等技術(shù)進(jìn)行HPV高、低?;蛐透腥救梭w組織后2-DE圖譜的差異比較,找出差異的蛋
7、白點(diǎn),通過質(zhì)譜分析,得到PMF圖,再由Mascot軟件搜索NCBInr數(shù)據(jù)庫,找到相應(yīng)蛋白點(diǎn)的功能信息,分析其表達(dá)改變的意義。 結(jié)果:通過對(duì)CIN組、CA組分別和正常宮頸組織、CIN組和CA組兩兩比較,每組分別找到了47、63、39個(gè)差異蛋白點(diǎn),共選26個(gè)差異倍數(shù)較大的蛋白點(diǎn)進(jìn)行分析,獲得了22張肽質(zhì)量指紋圖,軟件識(shí)別其有效肽片段峰后查詢數(shù)據(jù)庫,搜索后匹配到18個(gè)蛋白點(diǎn),通過查詢NCBInr數(shù)據(jù)庫,獲得初步鑒定的18個(gè)蛋白質(zhì)的功
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