α7-nAChR和α9α10-nAChR的同源模建與分子對(duì)接研究.pdf

1、煙堿型乙酰膽堿受體(nAChR)的兩種亞型α7-nAChR和α9α10-nAChR參與機(jī)體內(nèi)重要的生理與病理過程調(diào)控，常被作為重要的藥物作用靶點(diǎn)。本文首先對(duì)α7-nAChR和α9α10-nAChR進(jìn)行了同源模建，隨后對(duì)四個(gè)激動(dòng)劑和兩個(gè)拮抗劑與兩個(gè)受體模型分別進(jìn)行了分子對(duì)接的研究。
　　 同源模建的結(jié)果表明：采用2QC1和2BYR組合成的多模板模建的α7-nAChR和α9α10-nAChR的二聚體，經(jīng)過優(yōu)化和分子動(dòng)力學(xué)模擬，以PR

2、OCHECK、ERRAT及PROSA程序?qū)ζ溥M(jìn)行評(píng)價(jià)，證明模建的α7-nAChR和α9α10-nAChR是合理的。
　　 分子對(duì)接的結(jié)果表明：Ach和Nicotine與兩個(gè)受體模型的作用模式與文獻(xiàn)報(bào)道的結(jié)果在整體上具有一致性，進(jìn)一步驗(yàn)證了模型的合理性；通過對(duì)激動(dòng)劑和拮抗劑分別與α7-nAChR和α9α10-nAChR的作用模式進(jìn)行分析，預(yù)測(cè)了α7-nAChR主鏈上的Trp149和相對(duì)應(yīng)于α9α10-nAChR主鏈上的Trp150

3、是激動(dòng)劑與受體結(jié)合的關(guān)鍵氨基酸；α7-nAChR主鏈的Glu189以及α9α10-nAChR主鏈上的Tyr192和輔鏈的Arg58可能是拮抗劑與受體結(jié)合的關(guān)鍵氨基酸，其中α7-nAChR主鏈上的關(guān)鍵氨基酸殘基Trp149與文獻(xiàn)報(bào)道的一致。另外，通過從G-score，C-score，氫鍵作用，靜電作用和疏水作用五個(gè)方面進(jìn)行綜合分析，發(fā)現(xiàn)本實(shí)驗(yàn)的計(jì)算機(jī)模擬結(jié)果與生物活性數(shù)據(jù)整體上具有一致性，并對(duì)配體分子生物活性的差異以及選擇性的不同給出了理