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文檔簡介
1、肉雞生產(chǎn)是重要的國民經(jīng)濟產(chǎn)業(yè),也是我國畜牧業(yè)的支柱產(chǎn)業(yè)。研究肉雞遺傳育種具有重要意義。隨著生活水平的提高,黃皮膚和黑皮膚等膚色的肉雞越來越受到不同消費群體的偏愛。家雞的深色皮膚是由沉積于皮膚的黑色素細胞造成的,黑色素能夠由家雞自身通過復雜的過程合成。家雞淺膚色的形成決定于類胡蘿卜素在皮膚上的沉積量。因為家雞不能自身合成類胡蘿卜素,因此類胡蘿卜素的沉積與家雞體內能分解類胡蘿卜素的酶(BCMO1和BCDO2)有關。前者是機體合成維生素的關鍵
2、酶,后者與此過程雖無直接關聯(lián),但卻能非對稱裂解類胡蘿卜素使之變成無色產(chǎn)物,進而導致皮膚內類胡蘿卜素沉積量減少,形成白皮膚。本研究在前人的研究基礎上進行了更深入的拓展。
雞的BCDO2基因位于24號染色體上。已有研究表明存在三個關鍵SNPs與黃皮膚形成有關,SNPA(6,264,085處G突變?yōu)锳位點)、SNPB(6,273,428處A突變?yōu)镚)和SNPC(6,287,900處G突變?yōu)锳)。本研究以部分山東省地方雞種為樣品,通過
3、擴增獲得了該基因的片段,并通過測序技術得到擴增片段的詳細信息,進而找出了更多的SNPs位點,同時也將不同的基因型與家雞脛部皮膚顏色的黃度值(b*值)進行了關聯(lián)分析。另外,本研究探討了BCDO2基因在家雞不同組織中的差異表達狀況。最后,本研究又從表觀遺傳學的角度簡單了解了一下不同組織中該基因上游啟動子區(qū)甲基化程度和基因表達量的關系。
試驗結果如下。除已報道的經(jīng)典SNPs外,本研究又找到了17個SNPs位點。通過與脛色黃度值關聯(lián)分
4、析發(fā)現(xiàn)SNPA和SNPB以及另外8個位點與脛色黃度值顯著相關,SNPC與脛色黃度值相關性不顯著。21個SNPs中,4個位于第二內含子上,14個位于第九內含子上,2個位于第十外顯子上。呈低度多態(tài)性的共9個,呈中度多態(tài)性的共12個。共有6個位點處于哈代溫伯格平衡,其余均極顯著地偏離平衡。連鎖平衡分析顯示第14個SNPs位點與第17個SNPs位點間有極強烈的連鎖不平衡。通過對SNPB處雜合子個體的組織差異化表達研究結果顯示:BCDO2基因在脛
5、部皮膚中表達量顯著高于背部皮膚、肌肉組織、肝臟組織和卵巢組織。對不同組織中BCDO2基因上游啟動子區(qū)域進行甲基化檢測,發(fā)現(xiàn)隨著啟動子區(qū)甲基化程度的增加,基因表達量降低。說明了BCDO2基因在不同組織中的差異表達狀況可能與不同組織基因組中啟動子區(qū)的差異甲基化程度有關。
深入研究BCDO2基因的遺傳機理有著重要意義。一方面能為現(xiàn)代家禽育種工作中培育具有能夠穩(wěn)定遺傳的黃皮膚性狀的品種提供指導意義,另一方面能為揭示物種進化的奧秘提供思
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