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文檔簡介
1、目的:探討中國漢族人群PD-1基因PD-1.3(rs11568821),PD-1.5(rs2227981),PD-1.9(rs2227982),PD-1.1(rs36084323),PD-1.6(rs10204525)位點多態(tài)性與再生障礙性貧血(AA)的發(fā)生的相關(guān)性。
方法:收集中國漢族人確診再生障礙性貧血患者和健康者,采集外周靜脈血并用全血基因組試劑盒提取DNA;設(shè)計PD-1基因上三個多態(tài)性位點PD-1.3,PD-1.5
2、,PD-1.9的目的基因片段的特異性引物,并應用PCR方法擴增DNA樣本中的目的基因片段;采用聚合酶鏈反應-限制性片段長度多肽技術(shù)(PCR-RFLP)測定PD-1.3,PD-1.5和PD-1.9三個位點,采用直接測序法測定PD-1.1,PD-1.6兩個位點;采用病例對照研究,以漢族人群為研究對象,分析PD-1基因中五個位點的基因型在病例組和對照組中的基因型和等位基因頻率的差異,以檢驗多態(tài)性位點是否與再生障礙性貧血發(fā)生相關(guān)。
3、 結(jié)果:本研究共收集了166例中國漢族再生障礙性貧血病人及264例健康對照者,結(jié)果發(fā)現(xiàn),其中PD-1基因PD-1.3位點的基因型全部為G/G型;病例組和健康對照組PD-1.5位點C的等位基因攜帶頻率分別為74.7%和71.2%,(x2=1.245,P=0.273);PD-1.9位點C的等位基因攜帶頻率分別為81.3%和81.2%,(x2=0.001,P=1.000),兩個位點等位基因攜帶頻率兩組比較無顯著統(tǒng)計學差異。在病例組和健康對照組
4、PD-1.5位點的CC,CT及TT基因型頻率分別為54.3%,40.8%,4.9%和50.8%,40.9%,8.3%,病例組和健康對照組中PD-1.5位點CC與TT基因型相比的OR值為1.847(95%CI0.788-4.331,x2=2.038,P=0.168),CC及CT基因型相比的OR值為1.067(95%CI0.712-1.598,x2=0.098,P=0.759),TT及CT基因型相比的OR值為1.731(95%CI0.730
5、-4.109,x2=1.577,P=0.228);病例組和健康對照組PD-1.9位點的CC,CT及TT基因型頻率分別為65.1%,32.5%,2.4%和67.1%,28.4%,4.5%,病例組和健康對照組中PD-1.9位點CC與TT基因型相比的OR值為1.831(95%CI0.576-5.819,x2=1.078,P=0.427),CC及CT基因型相比的OR值0.847(95%CI0.555-1.295,x2=0.586,P=0.449
6、),TT及CT基因型相比的OR值2.160(95%CI0.661-7.063,x2=1.686,P=0.280),由此可見,這兩個位點的三種基因型在病例組和健康對照組中相比差異無統(tǒng)計學意義(P>0.05)。這兩個位點所構(gòu)成的四種單體型中,TC單體型頻率在病例組和對照組間有統(tǒng)計學差異(P<0.05)。對104例中國漢族再生障礙性貧血病人及162例健康對照通過直接測序法發(fā)現(xiàn),病例組和健康對照組PD-1.1位點G的等位基因攜帶頻率分別為49.
7、1%和40.8%,(x2=3.540,P=0.061);PD-1.6位點G的等位基因攜帶頻率分別為47.2%和45.1%,(x2=0.215,P=0.657),兩個位點等位基因攜帶頻率兩組比較差異無統(tǒng)計學意義。病例組和健康對照組PD-1.6位點的GG,GA及AA基因型頻率分別為23.1%,48.1%,28.8%和18.5%,53.1%,28.4%,病例組和健康對照組中PD-1.6位點GG與AA基因型相比的OR值為0.815(95%CI0
8、.402-1.653,x2=0.321,P=0.592),GG及GA基因型相比的OR值為0.727(95%CI0.383-1.378,x2=0.959,P=0.329),GG及GA+AA基因型相比的OR值為0.758(95%CI0.414-1.386,x2=0.813,P=0.435);在病例組和健康對照組PD-1.1位點的GG,GA及AA基因型頻率分別為25%,48.1%,26.9%和11.1%,59.3%,29.6%,病例組和健康對
9、照組中PD-1.1位點GG與AA基因型相比的OR值為0.404(95%CI0.189-0.864,x2=5.573,P=0.023),GG及GA基因型相比的OR值為0.361(95%CI0.181-0.720,x2=8.696,P=0.005),GG及GA+AA基因型相比的OR值為0.375(95%CI0.194-0.726,x2=8.850,P=0.004);由此可見,PD-1.1位點的三種基因型在病例組和健康對照組中相比有顯著統(tǒng)計學
10、差異(P<0.01)。
結(jié)論:中國漢族人群PD-1基因PD-1.3位點不呈現(xiàn)單核苷酸多態(tài)性,PD-1基因PD-1.5、PD-1.9和PD-1.6位點在漢族再生障礙性貧血組和正常對照組間多態(tài)性分布差異無顯著性,PD-1基因PD-1.5、PD-1.9和PD-1.6位點多態(tài)性與中國漢族人再生障礙性貧血發(fā)生無明顯相關(guān)性,但PD-1.5/PD-1.9位點所構(gòu)成TC單體型頻率在病例組和對照組間有統(tǒng)計學差異,可能與再障的發(fā)病有關(guān)。PD-
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