核糖體管道作用蛋白質折疊機制的模擬研究.pdf

1、蛋白質結構錯綜復雜，其折疊問題一直是研究的熱點。深入了解蛋白質的體內折疊機制在闡明蛋白質錯誤折疊的致病機理及尋找治療方法等方面都具有非常重大的意義。
　　為了研究核糖體輸出通道在蛋白質折疊初期所扮演的角色，構建了圓柱體的管道模型，選取多個小蛋白為研究對象，其中包括SH3結構域（PDB：2NUZ）、死亡結構域（PDB：1DGN）、絲氨酸蛋白酶抑制劑（PDB：2CI2）以及人類免疫缺陷病毒P6蛋白（PDB：2C55），進行全原子分子動

2、力學模擬計算，研究其在管道中的折疊行為。研究表明，前期在管道內的折疊可以有效促進蛋白質二級結構的形成；無論其天然態(tài)構象為全α螺旋、全β片層、α/β混合結構還是無序序列，在管道內的前期折疊都可以快速的形成穩(wěn)定的α螺旋，而且從管道中折疊的蛋白質被釋放到自由空間中以后，能快速塌陷形成局部的三級結構，已形成的二級結構仍然可以保持高度的穩(wěn)定性，對其后期折疊有正面的促進作用；其次，對于天然態(tài)結構中包含β片層的多肽，其在管道中的折疊不能形成或僅能形成