基于機(jī)器學(xué)習(xí)的蛋白質(zhì)相互作用關(guān)系抽取的研究.pdf

1、隨著生物醫(yī)學(xué)領(lǐng)域文獻(xiàn)的爆炸性增長(zhǎng),從生物醫(yī)學(xué)文獻(xiàn)中自動(dòng)獲取生物醫(yī)學(xué)知識(shí)已經(jīng)成為生物信息學(xué)研究的重要領(lǐng)域。由于蛋白質(zhì)相互作用關(guān)系對(duì)于生命科學(xué)有著特殊的重要意義,因而蛋白質(zhì)相互作用關(guān)系抽取成為當(dāng)前生物信息學(xué)的熱點(diǎn)問(wèn)題。
　　 由于生物醫(yī)學(xué)文獻(xiàn)的復(fù)雜性和多樣性,從中抽取蛋白質(zhì)相互關(guān)系是一個(gè)相當(dāng)困難的任務(wù)。本文應(yīng)用機(jī)器學(xué)習(xí)的方法對(duì)蛋白質(zhì)相互作用關(guān)系的抽取進(jìn)行了深入的研究,研究?jī)?nèi)容主要包括:
　　 1.研究基于特征向量的蛋白質(zhì)關(guān)系

2、抽取方法,重點(diǎn)探索了如何從自由文本中提取出各種表面特征和結(jié)構(gòu)化特征,并分析了這些不同的特征對(duì)蛋白質(zhì)關(guān)系抽取的貢獻(xiàn)；
　　 2.提出基于卷積樹(shù)核函數(shù)的蛋白質(zhì)關(guān)系抽取方法,分析了結(jié)構(gòu)化信息的表達(dá)形式對(duì)蛋白質(zhì)關(guān)系抽取的影響,為進(jìn)一步的研究奠定良好的基礎(chǔ):
　　 3.研究基于復(fù)合核函數(shù)的蛋白質(zhì)關(guān)系抽取方法,通過(guò)線性復(fù)合和多項(xiàng)式復(fù)合的方式將基于特征向量的方法和基于樹(shù)核函數(shù)的方法有機(jī)結(jié)合起來(lái),以期有效捕獲關(guān)系實(shí)例的平面特征和結(jié)構(gòu)化特