基于支持向量機(jī)的蛋白質(zhì)相互作用預(yù)測的研究.pdf

1、蛋白質(zhì)在生命活動中扮演著至關(guān)重要的角色，是實(shí)現(xiàn)生物功能最直接也是最重要的生物大分子。事實(shí)上，蛋白質(zhì)通過與其他的蛋白質(zhì)、復(fù)合物相互作用才能實(shí)現(xiàn)生物功能。通過對蛋白質(zhì)間相互作用的研究，可以進(jìn)一步了解生命活動的規(guī)律和機(jī)理。
　　 21世紀(jì)生命科學(xué)的重點(diǎn)已由實(shí)驗(yàn)分析和數(shù)據(jù)積累，開始向數(shù)據(jù)分析及其指導(dǎo)下的實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證轉(zhuǎn)移，生命科學(xué)正在經(jīng)歷著從分析還原思維到系統(tǒng)整合思維的轉(zhuǎn)變。相比于實(shí)驗(yàn)，計(jì)算機(jī)分析數(shù)據(jù)或者實(shí)驗(yàn)?zāi)M可以大量地節(jié)省人力、物力、時(shí)間

2、，可以進(jìn)一步提高生命科學(xué)研究的效率?；诘鞍踪|(zhì)間相互作用在理論和實(shí)踐上的重要意義，很多的數(shù)學(xué)工具已經(jīng)應(yīng)用到這方面研究上，出現(xiàn)了很多的預(yù)測方法，取得了一些結(jié)果?，F(xiàn)有的這些方法對于蛋白質(zhì)信息的要求較高，研究和開發(fā)基于低蛋白質(zhì)信息的預(yù)測方法就凸現(xiàn)了重要性。
　　 本文利用蛋白質(zhì)一級結(jié)構(gòu)信息，將支持向量機(jī)應(yīng)用于人的蛋白質(zhì)間相互作用預(yù)測中。為把蛋白質(zhì)間相互作用轉(zhuǎn)換為數(shù)學(xué)模型，需要將蛋白質(zhì)序列進(jìn)行數(shù)值化。本文采用三肽頻數(shù)方法編碼蛋白質(zhì)序列，