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文檔簡介
1、測序噬菌體基因組DNA序列分析,可以提供最可靠的信息顯示的結果,它可以充分描述具有復雜性和多樣性的基因,當前實驗室通常只能處理這些數(shù)據(jù)的小部分。生物信息學在各個領域軟件層出不窮,已被廣泛用于基因序列數(shù)據(jù)采集,處理,分析和管理,并一直在改進和完善。現(xiàn)代測序技術的飛速發(fā)展帶動了生物信息學的研究進展,在現(xiàn)在的生物領域越來越多的需要計算機技術與基因工程等生物與生物專業(yè)的結合,引入新的DNA測序噬菌體展示技術結合的結果,越來越需要在生物技術和基因
2、工程生物專業(yè)的輔助分析技術領域開發(fā)一個簡單的,免費的、功能相對全面的DNA測序分析軟件,也勢必成為一種趨勢。
在21世紀,這是個生物信息學日新月異、飛速發(fā)展的年代,有了DNA的檢測技術來推動研究者對 DNA的分子結構及其功能進行研究,對 DNA測序技術和 DNA測序結果的處理更是在對 DNA序列深入了解、分析和研究起到了很重要的作用,這也是生物技術、分子生物學要更上一個臺階所必不可少的關鍵。
噬菌體展示技術(Phag
3、e Display Techniques,PDT)是將外源的多肽或蛋白質的編碼基因通過基因工程的相關技術手段插入到編碼噬菌體外殼蛋白基因的適當位置,既不影響噬菌體外殼蛋白基因的正常表達,又能使外源基因編碼的多肽或蛋白質與噬菌體外殼蛋白融合并展示在噬菌體的表面的技術,噬菌體展示技術現(xiàn)在已經廣泛的適用于多種領域。在分子生物技術的應用中噬菌體展示已經成為現(xiàn)代生命科學研究最為常用的手段之一,其中,對外源插入序列進行 DNA測序是該技術不可或缺的
4、關鍵步驟,但是測序公司交付給研究者的測序結果通常包含有大量載體序列,往往需要研究者進一步人工提取并翻譯出插入的外源多肽序列,費時費力且易出錯。
MySeq是一個用Perl編寫的基于B/S架構的免費網(wǎng)絡程序,能夠讀取多種DNA測序儀的測序結果,自動判別噬菌體載體序列與外源插入序列,并將后者翻譯成為多肽序列,可為國內外相關研究工作帶來方便。本文便對 MySeq程序的背景、應用、實現(xiàn)流程等各個方面做了介紹。MySeq程序可從http
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