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文檔簡(jiǎn)介
1、心臟疾病是威脅人類健康的一大殺手,借助計(jì)算機(jī)仿真可以對(duì)心臟的工作原理、致病機(jī)制和藥物影響進(jìn)行定量和定性的研究。但是,進(jìn)行虛擬心臟仿真的效率問(wèn)題一直困擾著相關(guān)研究人員。
一方面,進(jìn)行仿真實(shí)驗(yàn)時(shí)經(jīng)常需要在實(shí)驗(yàn)進(jìn)行過(guò)程中修改參數(shù),試驗(yàn)相關(guān)參數(shù)對(duì)實(shí)驗(yàn)的影響。每次修改參數(shù),都需要重新開(kāi)始仿真實(shí)驗(yàn),修改參數(shù)之前的仿真計(jì)算存在浪費(fèi)時(shí)間的問(wèn)題,造成了實(shí)驗(yàn)效率的低下。本文提出借助駕馭式計(jì)算技術(shù)來(lái)解決這一問(wèn)題。
另一方面,在進(jìn)行組織模型
2、仿真時(shí)計(jì)算量非常巨大,使用基于CPU的算法只能借助服務(wù)器集群技術(shù)才能使得虛擬心臟仿真成為可能,但是服務(wù)器集群硬件成本過(guò)高,本文討論了基于GPU的并行算法來(lái)解決仿真計(jì)算的效率問(wèn)題,使得在個(gè)人計(jì)算機(jī)上進(jìn)行虛擬心臟仿真成為可能。
系統(tǒng)采用客戶端/服務(wù)器模式,客戶端采用QT圖形界面技術(shù)和VTK數(shù)據(jù)繪制技術(shù)作為基礎(chǔ)構(gòu)件,使用Python語(yǔ)言編寫。駕馭式控制邏輯使用有窮狀態(tài)自動(dòng)機(jī)描述。定義了一種基于TCP協(xié)議的通信方法在客戶端與服務(wù)端之間
3、進(jìn)行通信。
服務(wù)端使用CUDA(Compute Unified Device Architecture)技術(shù)實(shí)現(xiàn)了一種虛擬心臟仿真的GPU并行計(jì)算算法,以及在多GPU系統(tǒng)上擴(kuò)展的算法。采用動(dòng)態(tài)鏈接庫(kù)技術(shù)并結(jié)合Lua語(yǔ)言實(shí)現(xiàn)了一種細(xì)胞模型無(wú)關(guān)的仿真計(jì)算框架,使得系統(tǒng)可以方便的擴(kuò)展新的細(xì)胞模型。
本文通過(guò)從縱向?qū)Ρ攘薈PU仿真算法與GPU并行仿真算法的速度,表明GPU并行算法在數(shù)據(jù)量較大時(shí)具有非常明顯的優(yōu)勢(shì)。從橫向?qū)Ρ攘?/p>
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