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文檔簡介
1、馬立克氏病病毒RBlB株感染雞的蛋白質組、轉錄組學及天然免疫機理研究ProteomicsandtranscripteomicsofMarek’Sdiseasevirusinfectionandinnateimmunemachnism博士生:胡序明導師:秦愛建教授專業(yè):預防獸醫(yī)學資助項目:國家自然基金31272560國家自然基金31072135長江學者和創(chuàng)新團隊發(fā)展計劃IRT0978江蘇省優(yōu)勢學科建設項目省高校自然科學重大研究項目Gran
2、tNo12KJA23001江蘇省普通高校研究生科研創(chuàng)新計劃CXZZl209162013年揚州大學優(yōu)秀博士學位論文基金資助項目揚州大學2014年6月?lián)P州大學博士學位滄文研究證明RBIB感染SPF雞后,胸腺組織在感染后第21天、28天和35天呈現(xiàn)嚴重萎縮,在第42天逐漸恢復正常。以胸腺/體重為參數(shù)進行統(tǒng)計學分析結果表明,攻毒組在第7天、21天、28天和35天差異顯著(P005)。在胸腺組織蛋白樣品制各、水化、等電聚焦、平衡等條件的摸索并建立
3、雞胸腺蛋白質組學方法測定的基礎上,利用二維電泳和質譜分析技術共鑒定出119個差異表達的蛋白質,這些差異蛋白點主要集中在感染MDV后21、28和35天,與病理結果一致。GO注釋結果顯示:這些蛋白涉及到廣泛的生物學過程,主要包括代謝、免疫、細胞凋亡和死亡、應激以及腫瘤等各個方面:其中,有七類蛋白共20個差異蛋白點(包括巨噬細胞游走抑制因子、熱休克蛋白90等),與免疫、腫瘤發(fā)生、發(fā)展和轉移等直接相關。RealtimePCR對這些主要差異蛋白進
4、行了驗證。對主要差異蛋白的功能以及相互作用關系進行了分析討論,為進一步研究MDV宿主相互作用提供了胸腺蛋白質組圖譜,2RBlB感染雞胸腺病毒和宿主基因轉錄組表達變化本研究利用AffymetrixGeneChipChickenGenomeArrays(包含32773個雞轉錄物和684個病毒轉錄物)對MDV超強毒RBIB感染雞胸腺進行了全基因組芯片分析。研究結果表明,在RBIB感染后第7、14、21和28天的雞胸腺有86個病毒差異表達基因。
5、在感染后第7天,檢測到47個主要涉及病毒復制和免疫逃避的病毒基因。大多數(shù)病毒基因的表達在第21和28天增加,而在14天減少。與其他組織不同的是,我們發(fā)現(xiàn)在雞胸腺組織中,病毒潛伏感染期建立時間在第14天。該研究結果提供了馬立克氏病毒在雞胸腺組織中的動態(tài)表達規(guī)律。雞胸腺對MDV反應的轉錄組學分析結果表明,不同感染期共有594個與免疫、腫瘤、細胞周期與凋亡相關的差異基因,這些差異基因涉及到22條信號通路。GO分析顯示在第7天上調表達的基因涉及
6、免疫和炎癥應答,而在第21和28天上調表達的基因涉及血管發(fā)生、細胞骨架重排、細胞粘附、信號轉導。GAzer分析顯示上調的生物學過程包括細胞增殖、細胞基質粘附、血管發(fā)生、免疫和炎癥應答,其他生物學過程包括凋亡、細胞周期、有絲分裂、DNA復制、信使RNA加工、蛋白折疊、修飾和轉運等發(fā)生下調。Pathway分析發(fā)現(xiàn):與免疫、細胞周期與凋亡途徑下調,而與腫瘤相關的信號途徑上調。本研究結果提供了病毒感染對宿主基因表達的差異表達圖譜,為進一步解釋馬
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