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文檔簡介
1、交互效應(yīng)指兩個或多個因素相互依賴發(fā)生作用而產(chǎn)生的一種效應(yīng).當(dāng)考慮的因素較多時,特別是當(dāng)因素的個數(shù)遠(yuǎn)大于樣本容量時,傳統(tǒng)的交互效應(yīng)分析方法便不再適用,于是研究者致力于尋找新的統(tǒng)計(jì)方法和技術(shù)來解決高維數(shù)據(jù)的交互效應(yīng)檢驗(yàn)問題.
本文引入一種能夠勝任高維數(shù)據(jù)的交互效應(yīng)檢驗(yàn)方法,并將其應(yīng)用于一個包含288只NMRI雄性小鼠的真實(shí)數(shù)據(jù)集中.針對該小鼠群體的4種與復(fù)雜疾病有關(guān)的性狀,包括:血糖含量(GLU),高密度脂蛋白膽固醇(HDL)
2、等,在全基因組范圍內(nèi)進(jìn)行交互效應(yīng)檢測.探究SNPs位點(diǎn)之間或基因之間的交互效應(yīng)對準(zhǔn)確把握復(fù)雜疾病的發(fā)生與運(yùn)行機(jī)制十分有益.
結(jié)果顯示,對于性狀甘油三脂水平(TRI),交互效應(yīng)最顯著的單核苷酸多態(tài)位點(diǎn)(SNPs)為Chr5上73mb附近的rs33383056和Chr17上32mb附近的rs51655961,其P-值達(dá)到1.44E-05,并且位點(diǎn)rs33383056附近所對應(yīng)的兩個基因Ociad2,Cwh43分別與位點(diǎn)rs51
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