小鼠胚胎發(fā)育早中期卵黃囊基因表達譜的特點及功能探討.pdf

1、該研究所曾經應用PCR方法構建了C57BL6小鼠E9.5、E12.5的卵黃囊和E12.5的胎肝3個cDNA文庫,并通過EST測序及生物信息學等手段描繪了它們的基因表達譜特點,為我們理解胚胎發(fā)育過程中造血的起因提供了新線索.但是,通過建立文庫和測序的方法并不能很好地從量化上反映轉錄組的動態(tài)變化特點.為此,該研究擬應用cDNA芯片技術及其先進的生物信息學手段-CPP-SOM,來挖掘卵黃囊轉錄組在胚胎發(fā)育早中期的特點及其變化規(guī)律,篩選出參與、

2、調節(jié)卵黃囊造血、血管生成、營養(yǎng)、代謝等生理功能的關鍵基因,從而為進一步深入研究人類血液性重大疾病奠定基礎.通過比較這一系列樣本的CPP-SOM可以動態(tài)性地跟蹤卵黃囊在造血和血管生成過程中基因表達網絡的整體性變化.在所研究的8,722個基因當中,有3,121個基因被展示出來.根據CPP-SOM的功能分類結果,這些基因主要分為:結構及結構相關、物質能量代謝、物質轉運、增殖凋亡、信號轉導、造血、血管發(fā)育、血栓及氧化還原等九個類別.這些功能性集

3、團如實地反映了卵黃囊在造血及血管生成中的主要功能性分子網絡.結合卵黃囊在不同發(fā)育時期的生物學特征,可以推測:1胚胎發(fā)育早中期,即E9.5~E13.5期間,卵黃囊的能量代謝以有氧氧化為主.2卵黃囊合成多種運輸蛋白,向胎體提供營養(yǎng)供給.3卵黃囊的增殖活性下降,但局部有活躍的增殖群落,它們可能是造血細胞和血管生成相關的細胞.4造血干祖細胞早期被滯留于卵黃囊血管中,并迅速增殖,在E10.5之后才隨血流轉入胎體.5紅系造血活躍,分為原始、定向兩個