白鱘、達氏鱘線粒體DNA全序列及鱘形目分子進化研究.pdf

1、華中農(nóng)、Ik大學(xué)碩lj學(xué)位論文甲8U6622白鱘、達氏鱘線粒體DNA全序列及鱘形目分子進化研究THESTUDIESOFTHECOMPLETEMITOCHONDRIALDNAOFCHINESEPADDLEFISH(PSEPHURUSGL4DIU回ANDYANGTZESTURGEON以CIPENSERDABRYANU∞ANDMOLECULAREVOLUTIONARYPATTERNSINACIPENSERIFoRMES號業(yè)Specialty研

2、究方向Subject研究生Postgraduate導(dǎo)師Supervisor水產(chǎn)養(yǎng)殖Aquaculture生化及分子生物學(xué)Biochemical&molecularbiology汪登強WangDengQiang龍良啟教授Pro￡LongLiang—qi華中農(nóng)業(yè)大學(xué)水產(chǎn)學(xué)院中國湖北武漢430070TheCollegeofFishedesHuazhongAgriculturalUniversityWuhan，430070，China汪登強：白

3、鱘、達氏鱘線粒體DNA全序列及鱘形目分子進化研究質(zhì)編碼基因的氨基酸，12SrRNA，16SrRNA和tRNA序列分別構(gòu)建這七種鱘魚的MP樹和NJ樹。在10棵進化樹中，除12SrRNA的兩棵樹外，均能反應(yīng)鱘形目魚類的系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系，但13個蛋白質(zhì)編碼基因及其氨基酸序列具有最高的置信度。鱘形目魚類mtDNA有較高的轉(zhuǎn)換／顛換比，除16SrRNA只有252外，其余均達60左右。從序列歧化百分比看，蛋白質(zhì)編碼基因有較高的歧化值，并且在科、屬分類水

4、平上有明顯不同?？埔患壍乃缴戏N間的歧化值都在133％以上，屬一級的水平上種間的歧化值在10％左右，屬內(nèi)種問在4582％，種內(nèi)個體問只有O8％(匙吻鱘)。其它基因序列的歧化值約有蛋白質(zhì)編碼基因三分之一，科、屬種間的值變化范圍也不清晰。通過計算鱘形目mtDNA的堿基替換速率，tRNA、12S、16S、蛋白質(zhì)編碼基因同義替換(】(a)及非同義替換(ks)分別為O0097—0012910’9核苷／位點年、O00860011510。9核苷／位點