鸮形目鳥類線粒體調(diào)控區(qū)序列的測定與比較研究.pdf

1、本論文主要測定了鸮形目四種鳥類的線粒體調(diào)控區(qū)全序列，從比較基因組學和生物信息學的角度對鸮形目鳥類線粒體調(diào)控區(qū)的結構進行了研究分析，并對鳥類線粒體調(diào)控區(qū)的起源、進化、生理功能等進行了探討，進而研究串聯(lián)重復序列的起源和進化及形成的機制和生理功能等問題。 利用Long-PCR和Primer-Walking的方法對鸮形目的短耳鸮、長耳鸮、縱紋腹小鸮、灰林鸮四種鳥類的線粒體調(diào)控區(qū)進行了全序列測定。實驗結果表明：短耳鸮的調(diào)控區(qū)長度為3290

2、bp；長耳鸮為2848bp；縱紋腹小鸮為2444bp；灰林鸮為1771bp。短耳鸮的調(diào)控區(qū)長度是四種鸮中最大的，并且是目前已知最大的鳥類線粒體調(diào)控區(qū)。這四種鸮類調(diào)控區(qū)的基本結構和其它鳥類相似，按照堿基變化速率的不同可以分為三個區(qū)：堿基變化速率較快的外圍區(qū)域Ⅰ、ⅡⅢ和保守的中間區(qū)域Ⅱ。在這三個區(qū)中均存在一些序列保守的功能框，有些是脊椎動物所共有的，有些是鳥類所特有的。這四種鳥類調(diào)控區(qū)的3’端均存在大量的串聯(lián)重復序列，短耳鸮為126bp單元

3、重復7次和78bp單元重復14次，兩段重復區(qū)之間有99bp間隔；長耳鸮為127bp單元重復8次和78bp單元重復6次，重復區(qū)之間有55bp間隔；縱紋腹小鸮有3個重復單元，分別為89bp單元重復3次、77bp單元重復4次和71bp單元重復6次，89bp的重復單元與77bp重復單元之間僅有2bp間隔，77bp重復區(qū)與71bp重復區(qū)之間有64bp的間隔序列；灰林鸮僅有1個單元的串聯(lián)重復為78bp重復5次。分析表明調(diào)控區(qū)中串聯(lián)重復序列可能是由鏈