雀形目15種鳥類CoI和Cyt b基因序列比較及伯勞屬的系統(tǒng)發(fā)育.pdf

1、雀形目(Passeriformes)是現(xiàn)存鳥類中種類最多、數(shù)量最大的、演化地位最高、適應(yīng)輻射最廣的類群，傳統(tǒng)的分類方法僅依據(jù)形態(tài)和行為特征來劃分，但由于該類群的形態(tài)及行為特征復(fù)雜使得部分種類不易區(qū)分，因此有必要依據(jù)分子手段研究其系統(tǒng)發(fā)生關(guān)系、以盼能對(duì)經(jīng)典的分類方法給予補(bǔ)充。本文分別以線粒體DNA的細(xì)胞色素6和CoI基因作為分子標(biāo)記，對(duì)雀形目6科15種鳥類的細(xì)胞色素6基因全序列(1，143bp)和CoI基因部分序列(1，176bp)的組成

2、特點(diǎn)及其系統(tǒng)發(fā)育樹進(jìn)行了比較分析，還探討了CoI基因作為雀形目系統(tǒng)發(fā)育研究和構(gòu)建鳥類物種DNA編碼庫(kù)的分子標(biāo)記的可行性，旨在為DNA編碼庫(kù)的構(gòu)建積累基礎(chǔ)資料。此外，針對(duì)伯勞屬(Lanius)鳥類在形態(tài)分類上目前存在的一些爭(zhēng)論，還分析了該屬8種鳥類的細(xì)胞色素6全序列和Col基因部分序列，并以鶇亞科(Muscicapinae)的棕胸藍(lán)[姬]鶇(Ficedula hyperythra)和河烏科(Cinclidae)的褐河烏(Cincluspa

3、llasii)作為外群，分別構(gòu)建了單基因數(shù)據(jù)和聯(lián)合基因數(shù)據(jù)的MP樹、ML樹、NJ樹和Bayesian樹，在此基礎(chǔ)上初步分析了它們之間的系統(tǒng)發(fā)生關(guān)系，并探討了伯勞屬部分類群的分類地位。 1．比較分析了雀形目6科15種鳥類的細(xì)胞色素6全序列和CoI基因部分序列，結(jié)果顯示細(xì)胞色素6和CoI基因序列的變異位點(diǎn)分別為454個(gè)和366個(gè)、簡(jiǎn)約信息位點(diǎn)為337個(gè)和303個(gè)，而且線粒體CoI基因比細(xì)胞色素b基因略微保守、進(jìn)化速率也較低；CoI基

4、因在確定雀形目科級(jí)階元之間的系統(tǒng)發(fā)生關(guān)系方面是一種有效的分子標(biāo)記，同時(shí)它也能夠用于雀形目鳥類的物種鑒定，但在物種鑒別方面不如細(xì)胞色素6基因穩(wěn)定、準(zhǔn)確。本文建議若以CoI基因作為標(biāo)記進(jìn)行鳥類的物種鑒別，最好再輔以其它的分子標(biāo)記。 2．對(duì)伯勞屬鳥類的系統(tǒng)發(fā)生關(guān)系分析后表明，黑額伯勞(L.minor)和虎紋伯勞(L.tigrinus)首先分化出，接著分化出平行的兩個(gè)支系：一支由互為姐妹群的荒漠伯勞(L.isabellinus)和紅背伯

5、勞(L.collurio)組成，另一支由灰背伯勞(L.tephronotus)、牛頭伯勞(L.bucephalus)聚在一起后與紅尾伯勞(L.cristatus)并列再與棕背伯勞(L.schach)相聚而形成。由此可見，牛頭伯勞和灰背伯勞是最晚分化出的類群。 3．本文分析比較了兩種分子標(biāo)記及其聯(lián)合數(shù)據(jù)集所構(gòu)建的伯勞屬部分鳥類的系統(tǒng)發(fā)生樹和這些鳥類類群的形態(tài)特征、地理分布特點(diǎn)后表明，伯勞屬的荒漠伯勞、紅背伯勞均為獨(dú)立的物種；本文還