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文檔簡介
1、目的:
研究廣西地區(qū)人群RANTES基因-403G/A(rs2107538)和-28C/G(rs2280788)位點基因多態(tài)性的分布特征;分析RANTES基因-403G/A和-28C/G位點基因多態(tài)性與HBV背景下慢性肝炎(CHB)、肝硬化(LC)、肝癌(HCC)遺傳易感性的關(guān)聯(lián)性,為廣西地區(qū)HBV背景下CHB、LC、HCC的預(yù)防及治療提供新的遺傳指標(biāo)。
方法:
采用聚合酶鏈反應(yīng)-限制性片段長度多態(tài)性(PC
2、R-RFLP)技術(shù),對來自廣西地區(qū)229例健康人(健康對照組)和413例HBV感染病人(101例CHB患者、83例LC患者、229例HCC患者)的RANTES基因-403G/A和-28C/G兩位點進行基因分型,并用DNA直接測序法驗證。采用直接計數(shù)法對RANTES基因各SNP位點的基因型和等位基因頻率進行計算。采用擬合優(yōu)度卡方(x2)檢驗分析各SNP位點的基因型頻率在各組中的分布是否符合哈-溫平衡(HWE)。采用卡方(x2)檢驗或確切概
3、率法對各SNP位點基因型和等位基因在各組之間的分布差異進行比較。采用logistic回歸分析校正民族、性別、年齡、吸煙、飲酒、身體質(zhì)量指數(shù)等混雜因素,計算比值比(Oddsratio,OR)和95%可信區(qū)間(Confidence Intervals,CI),對RANTES基因多態(tài)性與HBV背景下CHB、LC、HCC的患病風(fēng)險進行關(guān)聯(lián)性分析。采用在線SHEsis軟件進行單倍型的構(gòu)建和分析。
結(jié)果:
1.RANTES基因-
4、403G/A(rs2107538)和-28C/G(rs2280788)的基因型頻率分布在各組中均符合HWE(P>0.05),說明本研究人群具有代表性和可比性。
2.廣西地區(qū)人群RANTES基因-403G/A(rs2107538)位點在存在GG、GA、AA三種基因型;-28C/G(rs2280788)位點存在CC、CG、GG三種基因型。總體而言,兩個SNP位點基因型和等位基因的頻率分布與其他亞洲地區(qū)人種相近,而與白色人種或黑色人
5、種差異較大。
3.在廣西壯族人群,RANTES基因-28C/G(rs2280788)位點的遺傳多態(tài)性與增加HBV相關(guān)HCC的致病風(fēng)險有關(guān):CG vs.CC,OR=3.044,95%CI,1.285-7.211; CG+GG vs.CC, OR=2.974,95%CI=1.284-6.892;和Gvs.C,OR=2.491,95%CI=1.178-5.268。在廣西漢族人群, RANTES基因-403G/A(rs2107538)
6、和-28C/G(rs2280788)基因多態(tài)性與HBV相關(guān)CHB、LC、HCC的患病風(fēng)險均無關(guān)(P>0.05)。
4.在女性人群,RANTES基因-403G/A(rs2107538)位點的遺傳多態(tài)性與降低慢性乙型肝炎的致病風(fēng)險有關(guān):GAvs.GG,OR=0.270,95%CI=0.073-0.999;GA+AA vs.GG,OR=0.276,95%CI=0.081-0.940。在男性人群, RANTES基因-403G/A(rs
7、2107538)和-28C/G(rs2280788)基因多態(tài)性與HBV相關(guān)CHB、LC、HCC的患病風(fēng)險均無關(guān)(P>0.05)。
5.RANTES基因-403G/A(rs2107538)位點和-28C/G(rs2280788)位點的基因多態(tài)性未見協(xié)同年齡、吸煙、飲酒等因素與HBV相關(guān)CHB、LC、HCC的致病風(fēng)險有關(guān)(P>0.05)。
6.RANTES基因-403G/A(rs2107538)和-28C/G(rs228
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