Acidiphilium屬菌細胞膜蛋白質(zhì)表達譜構(gòu)建.pdf

1、隨著鐵呼吸機制的深入研究,Acidiphilium sp.菌株的重要性也越來越被人們所重視。在生物冶金方面,利用Acidiphilium sp.菌株與其他微生物協(xié)同浸礦,可通過降低有機物對自養(yǎng)菌的毒害作用以及提供低pH環(huán)境而有效提高浸礦效率,并可再生Fe2+;在生物燃料方面,Acidiphilium sp.可在低pH環(huán)境中做為生物燃料電池的正極生物催化劑。
　　 本文通過提取Acidiphilium cryptum DX1-1菌

2、株膜相關(guān)蛋白,通過SDS-PAGE將膜蛋白分開,之后利用膠內(nèi)酶解技術(shù),采用液相色譜-串聯(lián)質(zhì)譜技術(shù)先對酶解后的蛋白進行分離,分離后的肽片段直接進入質(zhì)譜儀離子源進行一級和二級質(zhì)譜的分析,構(gòu)建Acidiphilium cryptumDX1-1菌株細胞膜相關(guān)蛋白質(zhì)的表達圖譜。通過Mascot數(shù)據(jù)庫進行搜庫比對,鑒定得到262個匹配蛋白。
　　 對這262個蛋白輸出信號及亞細胞定位進行預(yù)測,并對其功能進行分析和預(yù)測。這些已鑒定的這些已鑒定

3、的蛋白中13.7％有Sec-type信號肽,27.86％具有雙精氨酸轉(zhuǎn)運信號肽(Tat),18.32％的蛋白具有脂蛋白信號肽(Lipo),14.9％含有C末端GPI錨定信號序列的有,2.67％同時含有C端和N端錨定信號序列GPI錨定蛋白。統(tǒng)計等電點及分子量得知,蛋白質(zhì)的pH主要分布在4～12之間,40％蛋白質(zhì)的pI小于7;60％蛋白質(zhì)pI大于7;27.48％蛋白pI大于10。
　　 與Acidiphilium cryptum D

4、X1-1細胞壁蛋白比對,得到30個重復(fù)蛋白,包括3個能量代謝相關(guān)蛋白,8個運輸與結(jié)合蛋白,2個蛋白質(zhì)合成相關(guān)蛋白,2個蛋白質(zhì)修飾相關(guān)蛋白,3個假定蛋白,8個細胞包被蛋白以及4個功能未知蛋白。
　　 Acidiphilium cryptum DX1-.1細胞膜相關(guān)蛋白的表達圖譜的建立,為以后各種環(huán)境中細胞膜相關(guān)蛋白的研究提供了有價值的基礎(chǔ)性研究。從蛋白質(zhì)組學(xué)角度探討浸礦微生物鐵呼吸相關(guān)的蛋白質(zhì),為微生物鐵呼吸機理的研究提供一些依據(jù)