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1、目的:
探討利用非標(biāo)記定量技術(shù)(Label free quantitation)分析神經(jīng)管缺陷(Neural tube defects,NTDs)胎兒和正常胎兒的孕母血清中差異蛋白質(zhì)表達(dá)。
方法:
經(jīng)產(chǎn)前超聲診斷為NTDs胎兒的孕母血清10例作為病例組,包括脊柱裂5例,無(wú)腦兒2例,腦膨出3例。正常胎兒的孕母血清10例作為對(duì)照組。所有20例孕母均于清晨空腹取外周靜脈血5ml,離心后取血清,十二烷基硫酸鈉聚丙烯
2、酰胺凝膠電泳(SDS polyacrylamide gelelectrophoresis,SDS-PAGE)提取蛋白質(zhì),濾器輔助下蛋白質(zhì)組樣品制備(Filter aided proteome preparation,F(xiàn)ASP)酶解、肽段提取和脫鹽,非標(biāo)記定量結(jié)合液相色譜串聯(lián)質(zhì)譜(liquid chromatography tandem mass spectrometry technique,LC-MS/MS)鑒定蛋白質(zhì)肽段,結(jié)合unip
3、rot數(shù)據(jù)庫(kù)對(duì)差異蛋白質(zhì)的生物功能進(jìn)行生物信息學(xué)分析,包括Gene Ontology分析、信號(hào)通路分析和蛋白相互作用分析。
結(jié)果:
運(yùn)用非標(biāo)記定量蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)鑒定出差異表達(dá)蛋白17個(gè)。在病例組中有12個(gè)蛋白質(zhì)表達(dá)上調(diào),包括妊娠帶蛋白、補(bǔ)體C1q子組件A、B、C單元、互補(bǔ)DNA FLJ51564、互補(bǔ)DNA FLJ56954、互補(bǔ)DNA FLJ78071、血紅蛋白α、β亞基、碳酸酐酶1、角蛋白Ⅱ型細(xì)胞骨架80、過(guò)氧化
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