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1、隨著全基因組測(cè)序的完成,人們發(fā)現(xiàn)了芽殖酵母Saccharomycescerevisiae基因組包含了近6千個(gè)編碼蛋白質(zhì)的基因和未知功能的開(kāi)放閱讀框(OpenReadingFrame,ORF)。在本項(xiàng)研究工作中,我們對(duì)芽殖酵母的新基因IRC4的功能進(jìn)行了深入和系統(tǒng)的研究。
我們的研究結(jié)果顯示,將這個(gè)基因敲除可以導(dǎo)致細(xì)胞自發(fā)形成Rad52foci的水平上調(diào),而且它和DNA損傷檢查機(jī)制重要感應(yīng)因子Rad24具有相互作用,表明Ir
2、c4可能在DNA損傷響應(yīng)機(jī)制中起作用。另外,我們發(fā)現(xiàn),敲除Irc4的碳端(氨基酸139-189)所導(dǎo)致的細(xì)胞自發(fā)形成Rad52foci的水平與敲除全長(zhǎng)相似;而在Irc4單敲的品系中轉(zhuǎn)化入Irc4的碳端和全長(zhǎng),均可以將細(xì)胞自發(fā)形成的Rad52foci水平降低至背景水平。這些結(jié)果表明,Irc4的碳端是影響細(xì)胞自發(fā)形成Rad52foci的水平的主要區(qū)域。
我們的研究還發(fā)現(xiàn),Irc4蛋白可以和自吞噬重要蛋白激酶Atg1在體內(nèi)和體外
3、都能發(fā)生相互作用,但I(xiàn)rc4和Atg1的雙敲除品系的細(xì)胞自發(fā)產(chǎn)生Rad52foci的水平與Irc4單敲的品系很接近,意味著Irc4和Atg1通過(guò)同一個(gè)調(diào)控通路影響Rad52foci的水平。對(duì)Irc4的進(jìn)一步研究表明,Irc4的敲除,可以在一定程度上促進(jìn)酵母細(xì)胞在饑餓和Rapamycin處理?xiàng)l件下自噬小泡裝配位點(diǎn)的形成,同時(shí)還會(huì)部分地影響自吞噬進(jìn)程。因此我們猜測(cè),Irc4可能通過(guò)與Atg1這一自噬小泡裝配位點(diǎn)重要骨架蛋白的直接相互作用來(lái)影
4、響自噬小泡裝配位點(diǎn)的形成,而它自身可能也參與了自吞噬調(diào)控機(jī)制的某些功能。
綜上所述,我們認(rèn)為,Irc4既作用于DNA損傷響應(yīng)機(jī)制,也作用于自吞噬調(diào)控機(jī)制;它是酵母細(xì)胞內(nèi)這兩套重要生理調(diào)控機(jī)制之間的聯(lián)系分子。
另外,Elg1是重要的DNA復(fù)制和基因組穩(wěn)定性蛋白。我們的研究顯示,Irc4和Elg1的雙敲除品系的細(xì)胞自發(fā)產(chǎn)生Rad52foci的水平要遠(yuǎn)高于Irc4或者是Elg1單敲的品系,意味著它和Irc4是通過(guò)相
5、互獨(dú)立的兩條控制通路來(lái)影響細(xì)胞自發(fā)產(chǎn)生Rad52foci的水平。我們還采用酵母基因芯片研究了Elg1敲除細(xì)胞的細(xì)胞周期不同時(shí)相的基因表達(dá)譜。結(jié)果表明,Elg1敲除導(dǎo)致了一系列DNA損傷響應(yīng)相關(guān)的基因表達(dá)的變化,而且Elg1敲除的細(xì)胞比野生型的對(duì)DNA損傷抑制劑MMS更為敏感。因此,Elg1是重要的DNA損傷響應(yīng)機(jī)制的組成成分。在另一方面,Elg1的缺失導(dǎo)致了細(xì)胞周期行進(jìn)的異常;這一異常有可能是Elg1影響崗崎片斷的成熟相關(guān);并且該缺失還
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