水分子二聚體的從頭計(jì)算和ABEEM-MM方法的研究.pdf

1、遼寧師范大學(xué)碩士學(xué)位論文水分子二聚體的從頭計(jì)算和ABEEM/MM方法的研究姓名：于春陽申請(qǐng)學(xué)位級(jí)別：碩士專業(yè)：物理化學(xué)指導(dǎo)教師：楊忠志20080501A b s t r a c tC o n t e m ：T h ew a t e rd i m e r i s t h e a r c h e t y p ef o ra q u e o u sh y d r o g e n b o n d i n g ．T h ei n v e s t

2、i g a t i o n so fw a t e rd i m e r h a v ef o c m e do nt h eg l o b a lm i n i m u m a n de s s e n t i a l l yi g n o r e d t h e r e s t o ft h eo t h e r s t a t i o n a r y p o i n t s ．H i g h l e v e l a b i n i

3、 t i o m e t h o da n dA B E E M ／M M m o d e l a n do t h e rw a t e rf o r c e f i e l d m e t h o dw e r e u s e dt o s t u d yt h ep r o p e r t i e s o f t h e t e n s t a t i o n a r y p o i n t 0 nt h e w a t e r

4、d i m e r P E S ．F u l l g e o m e t r yo p t i m i z a t i o no ft h e t e n w a t e rd i m e r s t r u c t u r e s w e r ep e r f o r m e d w i t h t h em e t h o dm e n t i o n e d a b o v e ．V a r i o u s p r o p e r

5、 t i e so f t e ns t a t i o n a r yp o i n t so nt h ew a t e r d i m e r P E Ss u c h a sg e o m e t r i e s ，b i n d i n ge n e r g i e s ，s t a b i l i t i e s ，A B E E Mc h a r g ed i s t r i b u t i o n s ，d i p o

6、l em o m e m s ，h a v e b e e na l s oc o m p u t e db yt h ea b o v e m e t h o d ．C o m p a r e dw i t ht h eo t h e rf o r c ef i e l dm e t h o dw h i c h a p p l i e di nt h i s p a p e r ，o n l yA B E E M ／M M m o

7、d e lc a n o b t a i na l l t e n s t a t i o n a r y s t r u c t u r e s ．T h es t a t i o n a r y o r d e ro ft h e t e n s t a t i o n a r y s t r u c t u r e sc a l c u l a t e db yA B E E M ／M M m o d e li s a g r e

8、 ev e r yw e l lw i t ht h e h i g hl e v e la bi n i t i om e t h o d ．T h e d i p o l e m o m e n t so f t h e t e n s t a t i o n a r y s t r u c t u r e c a l c u l a t e d t h r o u g hA B E E M c h a r g ed i s t r

9、 i b u t i o ni sa l s ow e l lr e l e v a n tt ot h o s eo f t h eh i g hl e v e la bi n i t i om e t h o d ．T h e r e a s o n a b l e n e s sa n d t h ec o r r e c t n e s sa n d t r a n s f e r a b i l i t yo f t h ep

10、 a r a m e t e r so fA B E E M m o d e lh a s m o r ev a l i d a t e dt e s t w i t ht h ea b o v er e s u l t s ．T h em a s s i n e s sf o u n d a t i o n i s a l s o e s t a b l i s h e df o r c o g n i z i n gt h e m