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文檔簡介
1、橘核的主要藥理活性成分為檸檬苦素類化合物。課題從檸檬苦素類化合物生物合成路徑的中、下游階段選擇了三個功能基因開展深入研究——克隆、分析、表達(dá)了角鯊烯合成酶基因、角鯊烯環(huán)氧酶基因、檸檬苦素葡萄糖基轉(zhuǎn)移酶基因,分析了檸檬苦素類化合物成分在莖(韌皮部)、葉片、果皮、種子(胚)等器官的積累規(guī)律,為檸檬苦素類化合物生物合成機制和轉(zhuǎn)運規(guī)律的研究奠定了基礎(chǔ)。
1.樣本總RNA提取、功能基因克隆和生物信息學(xué)分析
采用Omega試劑盒
2、用于樣本總RNA提取并進(jìn)行凝膠電泳檢測,對純度符合要求的RNA逆轉(zhuǎn)錄。根據(jù)同源基因參考序列設(shè)計特異性引物,考察PCR條件,得到PCR產(chǎn)物,并對PCR產(chǎn)物進(jìn)行測序,從大紅袍Citrus reticulata‘Dahongpao’成熟種子(胚)中成功克隆獲得了ss、se、lgt基因序列。
對關(guān)鍵功能基因序列進(jìn)行比對和進(jìn)化分析,并對其所編碼的蛋白質(zhì)進(jìn)行序列比對,一級、二級、三級結(jié)構(gòu)預(yù)測,開放閱讀框識別、疏水性圖譜預(yù)測,信號肽切割位點
3、,對檸檬苦素類化合物生物合成路徑中功能基因和關(guān)鍵酶進(jìn)行進(jìn)一步的了解和分析,清楚其結(jié)構(gòu)和特點。
2.檸檬苦素類化合物生物合成過程中功能基因的表達(dá)
建立了大紅袍樣本的real-time PCR表達(dá)方法,得到了ss、se、lgt三個基因在莖(韌皮部)、葉、果皮、種子(胚)四個不同器官的基因相對表達(dá)量。
三個基因在種子(胚)中的主要表達(dá)趨勢為ss>se>lgt;三個基因在同一器官中的表達(dá)變化趨勢基本相同;四個不同器
4、官中主要基因表達(dá)變化時期為種子成熟期,種子形態(tài)建成末期和脫水期基因表達(dá)變化程度較小。
繁殖器官種子(胚)和果皮中基因表達(dá)情況基本相似,均為成熟期三個基因表達(dá)先上升后下降,存在一個最高表達(dá)時期,形態(tài)建成末期和脫水期三個基因表達(dá)量較低;而營養(yǎng)器官莖(韌皮部)和葉片中基因表達(dá)情況基本類似,均為形態(tài)建成末期三個基因表達(dá)先下降,再上升至最高值,存在一個高表達(dá)階段,成熟期三個基因表達(dá)上升、下降再上升至次高值,脫水期三個基因的表達(dá)較低。
5、r> 3.有效成分在各器官積累規(guī)律研究
采用UPLC法對不同時期所收集樣本中的檸檬苦素、諾米林、黃柏酮進(jìn)行了含量測定,對其積累和轉(zhuǎn)運規(guī)律進(jìn)行了初步研究。
檸檬苦素類成分在種子(胚)中分三個階段逐漸積累,形態(tài)建成末期先下降再上升至第一個次高值,成熟期先上升至第二個次高值后下降,脫水期快速積累達(dá)到最高值。檸檬苦素類化合物在種子(胚)中的含量較高,其含量在干燥期達(dá)到最高,推測種子(胚)可能是檸檬苦素類化合物的最終儲存位置
6、,果實完全成熟(12月中旬)前后為橘核藥材的最佳采收期之后有效成分含量急劇下降。
三個成分在四個不同器官中變化趨勢基本一致,且大小次序均為檸檬苦素>諾米林>黃柏酮。在130天果實和種子發(fā)育成熟階段,繁殖器官(種子)中有效成分總含量為升高趨勢,營養(yǎng)器官(莖、葉片)中有效成分總含量變化不明顯。推測有效成分可能是通過營養(yǎng)器官不斷向繁殖器官轉(zhuǎn)運,并在繁殖器官中積累。
4.基因表達(dá)量與成分積累的灰色關(guān)聯(lián)度分析
采用D
7、PS軟件對基因表達(dá)量和有效成分之間的關(guān)聯(lián)性進(jìn)行分析,種子(胚)中檸檬苦素、諾米林、黃柏酮各個有效成分含量積累貢獻(xiàn)最大的均為lgt基因,其次為ss和se基因。lgt主要是在檸檬苦素類化合物生物合成的下游階段,催化檸檬苦素類化合物轉(zhuǎn)化為相應(yīng)的葡萄糖苷過程中發(fā)揮作用。
莖(韌皮部)、葉片中檸檬苦素、諾米林、黃柏酮各個有效成分含量積累貢獻(xiàn)值最大的均為ss基因,其次為se和lgt基因。ss和se主要在檸檬苦素類化合物生物合成中游階段即角
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