軸突導(dǎo)向通路基因多態(tài)性和表達(dá)與廣西肝細(xì)胞癌遺傳易感性研究.pdf

1、目的：
　　(1)研究廣西扶綏壯族人群軸突導(dǎo)向通路PLXNC1基因、ITGβ1基因、RAC1基因多態(tài)性與廣西肝細(xì)胞癌遺傳易感性關(guān)系;(2)探討PLXNC1蛋白、ITGβ1蛋白、SEMA7A蛋白、RAC1蛋白在肝細(xì)胞癌中的表達(dá)情況。
　　方法：
　　(1)利用生物信息學(xué)方法篩選PLXNC1基因、ITGβ1基因、RAC1基因可能有意義的SNP位點(diǎn);以廣西扶綏縣20個(gè)肝細(xì)胞癌高發(fā)家族(79例)和10個(gè)正常對(duì)照家族(40例)為

2、研究對(duì)象，并將研究對(duì)象分為A、B、C三組:A組:肝癌高發(fā)家系肝細(xì)胞癌患者組，以下簡(jiǎn)稱(chēng)A組;B組:肝癌高發(fā)家系核心成員組（非肝癌患者），以下簡(jiǎn)稱(chēng)B組;C組:正常對(duì)照家系人群組，以下簡(jiǎn)稱(chēng)C組，運(yùn)用飛行時(shí)間質(zhì)譜技術(shù)(MALDI-TOF MS)檢測(cè)兩組中PLXNC1基因、ITGβ1基因、RAC1基因功能位點(diǎn)的基因型及等位基因頻率;(2)運(yùn)用免疫組化SP法檢測(cè)50例肝癌組織、50例肝癌癌旁組織、40例正常肝組織中PLXNC1、ITGβ1、SEMA

3、7A、RAC1蛋白表達(dá)情況。
　　結(jié)果：
　　(1)PLXNC1基因rs2272335位點(diǎn)經(jīng)分析，PLXNC1基因rs2272335位點(diǎn)B組人群中攜帶C等位基因型的個(gè)體發(fā)生HCC的風(fēng)險(xiǎn)分別是T等位基因型個(gè)體的0.47倍(95％CI=0.1-2.2)，但差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。C組人群中攜帶C等位基因型的個(gè)體發(fā)生HCC的風(fēng)險(xiǎn)分別是T等位基因型個(gè)體的4.16倍(95％CI=0.37-47.3)，差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P=0.032＜0.0

4、5)。肝癌高發(fā)家族(A+B)組中C等位基因型的分布頻率明顯高于正常對(duì)照(C)組，差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P=0.04＜.05，OR=7.6，95％CI:0.99-59.50)，經(jīng)性別、年齡、吸煙、飲酒、HBsAg等因素校正后，肝癌高發(fā)家族(A+B)組中C等位基因型的分布頻率明顯高于正常對(duì)照(C)組，差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P=0.03＜0.05，OR=5.09，95％CI:0.62-41.60)。
　　B組人群中攜帶TC基因型的個(gè)體發(fā)生HCC

5、的風(fēng)險(xiǎn)分別是TT基因型個(gè)體的0.68倍(95％CI=0.13-3.52)，但差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。C組人群中攜帶TC基因型的個(gè)體發(fā)生HCC的風(fēng)險(xiǎn)分別是TT基因型個(gè)體的4.3倍(95％CI=0.37-50.95)，但差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。肝癌高發(fā)家族(A+B)組中TC基因型的分布頻率明顯高于正常對(duì)照(C)組，但差異有無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P=0.10＞0.05，OR=5.82，95％CI:0.72-47.21)，經(jīng)性別、年齡、吸煙、飲酒、HBsAg等因素

6、校正后肝癌家族聚集性的風(fēng)險(xiǎn)仍然增高(OR=4.68，95％CI:0.54-40.17，P=0.15＞0.05)。與TT基因型相比，TC基因型在肝癌高發(fā)家族(A+B)組和正常對(duì)照(C)組間的分布頻率差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P=0.15＞0.05);
　　(2)ITGβ1基因rs22298141位點(diǎn)B組人群中攜帶G等位基因型的個(gè)體發(fā)生HCC的風(fēng)險(xiǎn)分別是A等位基因型個(gè)體的0.67倍(95％CI=0.31-1.45)。C組人群中攜帶G等位基因型

7、的個(gè)體發(fā)生HCC的風(fēng)險(xiǎn)分別是A等位基因型個(gè)體的0.75倍(95％CI=0.33-1.7)，但差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。等位基因A與G在肝癌高發(fā)家族(A+B)組中與正常對(duì)照(C)組中的分布頻率差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P＞0.05)。
　　B組人群中攜帶AG、GG基因型的個(gè)體發(fā)生HCC的風(fēng)險(xiǎn)分別是AA基因型個(gè)體的0.91倍(95％CI=0.31-2.71)和2.2倍(95％CI=0.40-11.96)。C組人群中攜帶AG、GG基因型的個(gè)體發(fā)生HCC

8、的風(fēng)險(xiǎn)分別是AA基因型個(gè)體的0.67倍(95％CI=0.22-2.1)和1.05倍(95％CI=0.17-6.6)。但差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。肝癌高發(fā)家族(A+B)組中AG基因型的分布頻率低于正常對(duì)照組(C)，但差異有無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P=0.44＞0.05，OR=0.72，95％CI:0.32-1.65)，經(jīng)性別、年齡、吸煙、飲酒、HBsAg等因素校正后患肝癌的風(fēng)險(xiǎn)降低差異仍無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(OR=0.63，95％CI:0.26-1.54，P=0.

9、31＞0.05)。肝癌高發(fā)家族(A+B)組中GG基因型的分布頻率與正常對(duì)照(C)組比較差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P=0.34＞0.05，OR=0.56，95％CI:0.18-1.82)，經(jīng)性別、年齡、吸煙、飲酒、HBsAg等因素校正后患肝癌的風(fēng)險(xiǎn)差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(OR=0.62,95％C1:0.18-2.20,P=0.46＞0.05);
　　(3)RAG1基因rs6951997位點(diǎn)B組人群中攜帶G等位基因型的個(gè)體發(fā)生HCC的風(fēng)險(xiǎn)分別是T等

10、位基因型個(gè)體的0.73倍(95％CI=0.08-6.7)。C組人群中攜帶G等位基因型的個(gè)體發(fā)生HCC的風(fēng)險(xiǎn)分別是T等位基因型個(gè)體的0.49倍(95％CI=0.30-8.1)，但差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。等位基因T與G在肝癌高發(fā)家族(A+B)組中的分布頻率分別為96.84％、3.16％，在正常對(duì)照(C)組中的分布頻率分別為98.75％、1.25％，兩組間差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P＞0.05)。見(jiàn)表16
　　RAC1基因rs6951997位點(diǎn)B組人

11、群中攜帶GT基因型的個(gè)體發(fā)生HCC的風(fēng)險(xiǎn)分別是TT基因型個(gè)體的0.72(95％CI=0.08-6.9)。C組人群中攜帶GT基因型的個(gè)體發(fā)生HCC的風(fēng)險(xiǎn)分別是TT基因型個(gè)體的2.05倍(95％CI=0.12-34.63)。但差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。肝癌高發(fā)家族(A+B)組中GT基因型的分布頻率明顯高于正常對(duì)照(C)組，但差異有無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P=0.38＞0.05，OR=2.64，95％CI:0.30～23.35)，經(jīng)性別、年齡、吸煙、飲酒、HB

12、sAg等因素校正后患肝癌的風(fēng)險(xiǎn)仍然增高(OR=2.02，95％CI:0.21-19.88，P=0.55＞0.05)。與TT基因型相比，GT基因型在肝癌高發(fā)家族(A+B)組和正常對(duì)照(C)組間的分布頻率差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P=0.55＞0.05)。
　　(4)肝癌組織中，PLXNC1蛋白表達(dá)水平(3.12±1.12)顯著高于肝癌癌旁組織(1.54±0.67)和正常肝組織(1.23±0.87)(P＜0.05)，但PLXNC1蛋白表達(dá)水平

13、在肝癌癌旁組織和正常肝組織間比較無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)差異(P＞0.05)。
　　(5)肝癌組織中，ITGβ1蛋白表達(dá)水平(3.45±1.25)顯著高于肝癌癌旁組織(1.76±0.98)和正常肝組織(1.02±0.56)(P＜0.05)，在肝癌癌旁組織中，ITGβ1蛋白表達(dá)水平顯著高于正常肝組織(P＜0.05))。
　　(6)肝癌組織中，SEMA7A蛋白表達(dá)水平(3.03±1.07)顯著高于肝癌癌旁組織(1.47±0.58)和正常肝組織(

14、1.17±0.92)(P＜0.05)，但SEMA7A蛋白表達(dá)水平在肝癌癌旁組織和正常肝組織間比較無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)差異(P＞0.05)。
　　(7)肝癌組織中，RAC1蛋白表達(dá)水平(3.25±1.14)顯著高于肝癌癌旁組織(1.68±0.87)和正常肝組織(0.92±0.67)(P＜0.05)，在肝癌癌旁組織中，RAC1蛋白表達(dá)水平顯著高于正常肝組織(P＜0.05)。
　　(8)PLXNC1蛋白、ITGβ1蛋白、SEMA7A蛋白、RA

15、C1蛋白表達(dá)水平與HCC患者性別、年齡、腫塊大小、HBsAg、 AFP間無(wú)明顯差異(P＞0.05)。
　　結(jié)論：
　　1、PLXNC1基因rs2272335位點(diǎn)C等位基因型可能是HCC發(fā)生的風(fēng)險(xiǎn)基因型，PLXNC1基因rs2272335位點(diǎn)與廣西肝細(xì)胞癌遺傳易感性顯著相關(guān);ITGβ1基因rs22298141位點(diǎn)多態(tài)性與廣西肝細(xì)胞癌遺傳易感性未發(fā)現(xiàn)顯著相關(guān);RAC1基因rs6951997位點(diǎn)多態(tài)性與廣西肝細(xì)胞癌遺傳易感性未發(fā)現(xiàn)