多通路基因檢測用于預測乳腺癌新輔助化療療效的研究.pdf

1、乳腺癌是一種常見的惡性腫瘤疾病。它位居女性惡性腫瘤發(fā)病率的第一。臨床上新輔助化療作為治療乳腺癌的一種手段越來越廣泛應用。采用新輔助化療可以縮小病灶，利于腫瘤切除及增加保乳手術(shù)機會。但是有部分患者對新輔助化療不敏感，這需要多種潛在的指標對乳腺癌新輔助化療的療效進行預測將有效提高預測的準確性。
　　本研究從浙江省腫瘤醫(yī)院共收集到32例新輔助化療前乳腺癌組織樣本，根據(jù)化療后的療效分為兩組，達到病理完全緩解（pCR）組和非病理完全緩解(N

2、pCR)組。首先將3例乳腺癌患者新輔助化療后達到pCR效果的化療前樣本和3例未達到pCR效果的樣本進行多樣本混合構(gòu)建文庫進行高通量測序。通過對測序結(jié)果分析，篩選出差異表達的基因，并將差異表達基因進行GO和KEGG功能富集。熒光定量分析目標通路基因在15例pCR和17例NpCR樣本中的差異表達情況，結(jié)合年齡、雌激素受體水平、孕激素受體水平、HER2臨床指標進行分析其相關(guān)性。對比TCGA數(shù)據(jù)庫分析目標基因在971例乳腺癌組織樣本中的表達水平

3、，分析其總生存期和無病生存期，推測其和乳腺癌新輔助化療敏感性的關(guān)系。
　　研究發(fā)現(xiàn)，通過高通量測序，共獲得出715條差異表達的基因，然后將篩選出來的差異表達基因進行GO和KFGG功能富集，得到PSMB10、UBD、UBE2C、UBE2S、CCL2、CCR1、CXCL10、CXCL11、IL2RG這9個與泛素介導的蛋白酶體水解途徑，細胞因子和其受體間相互作用途徑有關(guān)的差異表達基因。熒光定量結(jié)果顯示，這9條基因在pCR和NpCR組織樣

4、本中的表達水平具有顯著的差異性，在乳腺癌患者新輔助化療后達到pCR組織樣本中顯著高表達。本課題為了驗證在這32例乳腺癌組織樣本中兩條通路基因的表達量能否預測乳腺癌新輔助化療療效，我們建立一個了邏輯回歸方程來預測。從TCGA數(shù)據(jù)庫發(fā)現(xiàn)PSMB10、UBD、UBE2C、CXCL10、CXCL11、IL2RG高表達的患者的總生存期、無病生存期明顯長于低表達的患者，預后較好。因此我們推測這9條基因高表達的乳腺癌患者可能更適合新輔助化療治療，達到