肺腺癌癌旁基因組異常情況分析及初步功能研究.pdf

1、肺癌作為全世界發(fā)病率最高和致死人數(shù)最多的癌癥，發(fā)病原因包括吸煙、職業(yè)暴露、空氣污染和基因突變等，2015年中國(guó)腫瘤登記年報(bào)顯示，肺癌仍居中國(guó)發(fā)病率的首位。半個(gè)多世紀(jì)以來全世界在肺癌的手術(shù)、放療、化療及靶向治療方面取得了巨大的進(jìn)展和成績(jī)，但由于缺乏有效的早期診斷方法且肺癌患者出現(xiàn)癥狀時(shí)多為晚期，因而總的5年存活率不到15％。基因突變作為肺癌發(fā)生的誘因之一，突變率隨著環(huán)境污染的加劇而不斷提高，細(xì)胞癌變的概率也隨之增加。肺癌的特點(diǎn)之一是具有異

2、質(zhì)性，對(duì)基因突變的分析對(duì)于揭示肺癌發(fā)生發(fā)展有重要作用，隨著肺癌測(cè)序技術(shù)的快速發(fā)展，越來越多的突變基因被發(fā)現(xiàn)，其中包括EGFR、KRAS等一些肺癌發(fā)生中重要的驅(qū)動(dòng)突變，為肺癌的早期診斷和靶向治療提供了新的方向。
　　與腫瘤組織一樣，腫瘤的正常對(duì)照組織也同樣暴露在煙草等環(huán)境致癌物中，為了研究這些組織基因組在環(huán)境致癌物中發(fā)生的變化，我們從TCGA數(shù)據(jù)庫下載了513例肺腺癌病人的全外顯子數(shù)據(jù)，篩選出癌旁特有的基因組異常點(diǎn)并過濾掉體細(xì)胞突變

3、，統(tǒng)計(jì)突變特征并對(duì)病人進(jìn)行生存分析后繪制病人生存曲線，然后選取癌旁組織突變與病人預(yù)后相關(guān)的基因進(jìn)行初步的功能研究。在癌旁組織突變基因中，外顯子突變頻率為0.93/Mb，堿基突變以C∶G＞T∶A的置換為主，有29個(gè)基因突變率大于3％，其中ZNF511和TMEM184A與預(yù)后成正相關(guān)，其中ZNF511在513例病人中有16例癌旁發(fā)生突變且該基因存在三種突變情況，突變的結(jié)果是蛋白質(zhì)產(chǎn)物的縮短或延長(zhǎng)，癌旁中ZNF511發(fā)生突變與病人的預(yù)后是成正

4、相關(guān)的。然而目前對(duì)于ZNF511基因功能還尚未有研究，因此我們想通過基因的過表達(dá)和干擾對(duì)ZNF511進(jìn)行初步的功能研究。因此我們對(duì)ZNF511瞬時(shí)轉(zhuǎn)染同時(shí)構(gòu)建慢病毒穩(wěn)轉(zhuǎn)株，設(shè)計(jì)并合成了小RNA干擾序列在肺腺癌細(xì)胞系A(chǔ)549細(xì)胞中進(jìn)行干擾，初步顯示敲低ZNF511后對(duì)細(xì)胞增殖能力有一定抑制作用，且可以引起pAKT的下調(diào)。
　　總之，本文對(duì)肺腺癌中正常的對(duì)照組織基因組變異情況進(jìn)行了系統(tǒng)的分析、并對(duì)ZNF511基因功能做了初步研究，為肺