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文檔簡介
1、目的:
最新研究提示lncRNAs參與了癌癥的發(fā)生與進程,可以調(diào)控細胞周期,存活,免疫應(yīng)答,細胞干性或腫瘤細胞轉(zhuǎn)化,而在腫瘤的發(fā)生與進程中發(fā)揮促腫瘤或抑制腫瘤的功能。
盡管現(xiàn)階段研究提示非編碼RNAs參與調(diào)控胃癌的發(fā)生與進程,但大量非編碼RNAs(miRNAs和lncRNAs)在胃癌中表達和功能調(diào)控分子機制仍舊不清楚。闡明非編碼RNAs在胃癌中的作用及其分子機制,將豐富我們對胃癌的發(fā)生與進程的認識,同時也將為胃癌的診
2、斷和治療提供了新的理論依據(jù)和實驗基礎(chǔ)。
方法:
第一部分:MiR-141靶向調(diào)控TAZ抑制胃癌生長、侵襲和轉(zhuǎn)移的分子作用機制研究
1.高通量轉(zhuǎn)錄組芯片測定4例胃癌患者配對的癌組織和癌旁組織的miRNAs譜,采用ATC進行差異表達miRNAs的篩選和數(shù)據(jù)挖掘。
2.采用qRT-PCR檢測36例配對胃癌組織和癌旁組織miR-141表達水平,比較miR-141在癌組織與癌旁組織的表達差異,并結(jié)合臨床數(shù)據(jù)
3、分析miR-141與胃癌患者臨床病理轉(zhuǎn)移的相關(guān)性。
3.評價miR-141對胃癌細胞腫瘤表型的影響。
5.采用qRT-PCR檢測36例配對胃癌組織和癌旁組織TAZ表達水平,比較TAZ在癌組織和癌旁組織的差異,并結(jié)合miR-141表達水平,分析miR-141與TAZ表達水平的相關(guān)性。
6.評價TAZ對胃癌細胞腫瘤表型的影響。
7.評價miR-141對胃癌體內(nèi)生長和轉(zhuǎn)移的影響。
第二部分:M
4、iR-22靶向調(diào)控MMP14和Snail抑制胃癌生長和轉(zhuǎn)移的分子作用機制研究
1.采用qRT-PCR檢測61例配對胃癌組織和癌旁組織miR-22表達水平,比較miR-22在癌組織與癌旁組織的表達差異。結(jié)合臨床數(shù)據(jù)分析miR-22與胃癌患者臨床病理分期分級,轉(zhuǎn)移和預(yù)后生存率的相關(guān)性。
2.評價miR-22對胃癌細胞腫瘤表型的影響。
3.鑒定miR-22的靶基因。
4.采用qRT-PCR檢測61例配對
5、胃癌組織和癌旁組織MMP14(Snail)表達水平,并結(jié)合miR-22表達水平,分析miR-22與MMP14(Snail)表達水平的相關(guān)性。
5.評價MMP14(Snail)對胃癌細胞腫瘤表型的影響。
6.評價miR-22對胃癌體內(nèi)生長、播散和轉(zhuǎn)移的影響。
第三部分:長鏈非編碼RNA PVT1促進胃癌侵襲轉(zhuǎn)移的作用機制研究
1.高通量轉(zhuǎn)錄組芯片測定4例胃癌患者配對的癌組織和癌旁組織的lncRNAs
6、譜,采用ATC進行差異表達lncRNAs的篩選和數(shù)據(jù)挖掘。差異lncRNAs的篩選標準是:P值≤0.05且倍數(shù)改變≥1.5。
2.采用qRT-PCR檢測42例配對胃癌組織和癌旁組織PVT1表達水平,比較PVT1在癌組織與癌旁組織的表達差異,并結(jié)合臨床數(shù)據(jù)分析PVT1與胃癌患者分期分級、轉(zhuǎn)移的相關(guān)性。
3.評價PVT1對胃癌細胞腫瘤表型的影響。
4.評價PVT1對EMT的影響。
5.評價PVT1對胃
7、癌體內(nèi)生長和轉(zhuǎn)移的影響。
6.為證實PVT1與miR-30a結(jié)合,采用生物信息學(xué)軟件Targetscan預(yù)測PVT1潛在結(jié)合的miRNAs,RIP和雙熒光素酶報告基因?qū)嶒炶b定PVT1是否與miR-30a結(jié)合。
結(jié)果:
第一部分: MiR-141靶向調(diào)控TAZ抑制胃癌生長、侵襲和轉(zhuǎn)移的機制研究結(jié)果
1.轉(zhuǎn)錄組芯片篩選16個miRNAs在癌組織和癌旁組織差異表達顯著,具有顯著性統(tǒng)計學(xué)差異,(篩選標準:
8、P≤0.05且倍數(shù)改變≥1.5)。
2.qRT-PCR檢測發(fā)現(xiàn)miR-141在胃癌組織相比較于癌旁組織,其表達降低,具有顯著性統(tǒng)計學(xué)差異(P<0.001),且與胃癌的轉(zhuǎn)移相關(guān)。
3.CCK-8增殖,劃痕和Transwell侵襲轉(zhuǎn)移實驗顯示,miR-141mimics組與mimicscontrol組比,抑制了HGC-27細胞的增殖、侵襲和轉(zhuǎn)移,具有顯著性統(tǒng)計學(xué)差異(P<0.05)。Anti-miR-141組與anti-
9、miR-control組相比,促進AGS細胞的增殖、侵襲和轉(zhuǎn)移,具有顯著性統(tǒng)計學(xué)差異(P<0.05)。
4.生物信息學(xué)Targetscan預(yù)測,轉(zhuǎn)錄組mRNA芯片篩選,雙熒光素酶報告基因?qū)嶒烇@示miR-141能夠靶向結(jié)合TAZ3'UTR,表明Hippo通路TAZ是miR-141靶基因。
5.TAZ在胃癌組織相比較于癌旁組織,其表達上調(diào)2.01倍,具有顯著性統(tǒng)計學(xué)差異(P<0.01)。相關(guān)性分析發(fā)現(xiàn)36例胃癌組織中TA
10、Z與miR-141的表達呈負相關(guān)(r=-0.507,P<0.01)。
6.TAZ干擾和過表達實驗結(jié)果顯示, Si_TAZ組與對照Si_con組相比,胃癌細胞增殖、侵襲和轉(zhuǎn)移能力受到抑制,均具有顯著性統(tǒng)計學(xué)差異(P<0.05)。與pcDNA3.1空載體組相比,pcDNA3.1-TAZ組胃癌細胞增殖、侵襲和轉(zhuǎn)移能力增強,均具有顯著性統(tǒng)計學(xué)差異(P<0.05)?;貜?fù)實驗發(fā)現(xiàn)TAZ能夠逆轉(zhuǎn)miR-141對胃癌細胞腫瘤生物學(xué)功能表型的抑
11、制。
7.裸鼠移植瘤模型顯示,與agomir-NC-HGC-27組相比,agomir-141-HGC-27組的腫瘤體積、質(zhì)量均降低,均具有顯著性統(tǒng)計學(xué)差異(P<0.05)。結(jié)果表明,miR-141能夠抑制體內(nèi)胃癌細胞的生長和遠端肺轉(zhuǎn)移。
第二部分:MiR-22靶向調(diào)控MMP14和Snail抑制胃癌生長和轉(zhuǎn)移的機制研究結(jié)果
1.qRT-PCR檢測發(fā)現(xiàn)miR-22在胃癌組織相比較于癌旁組織,其表達顯著降低,差異
12、具有統(tǒng)計學(xué)意義(P<0.001),且與胃癌的分期分級,轉(zhuǎn)移相關(guān)。
2.CCK-8增殖,劃痕和Transwell侵襲轉(zhuǎn)移實驗顯示,miR-22 mimics組與mimicscontrol組比,抑制了SGC-7901細胞的增殖、侵襲和轉(zhuǎn)移,具有顯著性統(tǒng)計學(xué)差異(P<0.05)。
3.生物信息學(xué)Targetscan預(yù)測,轉(zhuǎn)錄組mRNA芯片篩選,雙熒光素酶報告基因?qū)嶒烇@示miR-22能夠靶向結(jié)合MMP14和Snail3'UT
13、R,表明MMP14和Snail是miR-22靶基因。
4.相關(guān)性統(tǒng)計分析發(fā)現(xiàn)61例胃癌組織中MMP14的mRNA表達水平與miR-22的表達呈負向相關(guān)(r=-0.366,P<0.01);Snail的mRNA表達水平與miR-22的表達也呈負向相關(guān)(r=-0.444,P<0.01)。
5.MMP14和Snail干擾和過表達實驗結(jié)果顯示,Si_MMP14(Snail)組與對照Si_con組相比,胃癌細胞侵襲和轉(zhuǎn)移能力受到
14、抑制,均具有顯著性統(tǒng)計學(xué)差異(P<0.05)。
6.裸鼠移植瘤模型顯示,與agomir-NC-SGC-7901組相比,agomir-22-SGC-7901組的腫瘤體積、質(zhì)量均降低,均具有顯著性統(tǒng)計學(xué)差異(P<0.05)。
第三部分:長鏈非編碼RNA PVT1促進胃癌侵襲轉(zhuǎn)移的機制研究結(jié)果
1.轉(zhuǎn)錄組芯片篩選50個lncRNAs在癌組織和癌旁組織差異表達顯著,具有顯著性統(tǒng)計學(xué)差異,(篩選標準:P≤0.05且倍
15、數(shù)改變≥1.5)。
2.qRT-PCR檢測發(fā)現(xiàn)PVT1在胃癌組織相比較于癌旁組織,其表達上調(diào),具有顯著性統(tǒng)計學(xué)差異(P<0.05),且與胃癌的分期分級、轉(zhuǎn)移相關(guān)。
3.劃痕和Transwell侵襲轉(zhuǎn)移實驗顯示,pcDNA3.1-PVT1組與pcDNA3.1組比,顯著促進了AGS細胞的遷移、侵襲和轉(zhuǎn)移,差異均具有統(tǒng)計學(xué)意義(P<0.05)。
4.免疫熒光,qRT-PCR和免疫印跡結(jié)果顯示,pcDNA3.1-P
16、VT1組與pcDNA3.1組比,過表達PVT1抑制了E-cadherin表達,而促進N-cadherin,Snail,ZEB1和ZEB2表達,提示PVT1影響了EMT相關(guān)分子的表達。
5.裸鼠移植瘤模型顯示,Lv-PVT1組的腫瘤體積、質(zhì)量顯著高于對照Lv-control組,差異均具有統(tǒng)計學(xué)意義(P<0.05)。
6.生物信息學(xué)Targetscan預(yù)測,RNA共沉淀和雙熒光素酶報告基因檢測證實PVT1能夠結(jié)合miR-
17、30a,提示PVT1可能發(fā)揮miRNAs分子海綿吸附功能。
結(jié)論:
第一部分:MiR-141靶向調(diào)控TAZ抑制胃癌生長、侵襲和轉(zhuǎn)移的分子作用機制研究
系統(tǒng)篩選鑒定了胃癌相關(guān)miRNAs,確定miR-141是潛在的胃癌抑癌miRNA。其發(fā)揮抑癌作用,至少部分是依賴于其靶向調(diào)控的Hippo通路組成因子TAZ。
第二部分:MiR-22靶向調(diào)控MMP14和Snail抑制胃癌生長和轉(zhuǎn)移的分子作用機制研究
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