肝癌復(fù)發(fā)相關(guān)16號(hào)染色體拷貝數(shù)變異及差異表達(dá)基因篩選.pdf

1、目的：
　　肝細(xì)胞癌（Hepatocellular carcinoma，HCC）是一種預(yù)后差的惡性腫瘤，手術(shù)切除仍是目前最主要的治療方法，而術(shù)后肝內(nèi)復(fù)發(fā)是治療失敗的最重要原因。16號(hào)染色體（Chromosome16，Chr16）拷貝數(shù)變異（Copy number aberration，CNA）頻繁發(fā)生于 HCC中，研究發(fā)現(xiàn)其與多種腫瘤的臨床預(yù)后密切相關(guān)。本研究旨在探討 Chr16 CNAs與 HCC術(shù)后肝內(nèi)復(fù)發(fā)的相關(guān)性，并篩選復(fù)發(fā)

2、相關(guān)CNA片段上的差異表達(dá)基因。
　　方法：
　　1．采用微陣列比較基因組雜交（Array comparative genomic hybridization，aCGH）平臺(tái)檢測(cè)具有完整術(shù)后復(fù)發(fā)隨訪資料（隨訪時(shí)間3~73個(gè)月）的66例HCC樣本的Chr16 CNAs情況。應(yīng)用 Log-rank檢驗(yàn)，Kaplan-Meier生存分析及多因素 Cox風(fēng)險(xiǎn)比例模型（Cox proportional hazards models）分

3、析 Chr16 CNAs與HCC術(shù)后肝內(nèi)復(fù)發(fā)的相關(guān)性。
　　2．對(duì)109例樣本進(jìn)行 aCGH和基因表達(dá)聯(lián)合分析，篩選 HCC肝內(nèi)復(fù)發(fā)相關(guān) CNA片段上的差異表達(dá)基因?；?mRNA表達(dá)的組間比較采用 Mann-Whitney U檢驗(yàn)。
　　結(jié)果：
　　1．66例 HCC中，16號(hào)染色體長(zhǎng)臂（16q）丟失占62.1％，短臂（16p）丟失占51.5%。Chr16高頻（發(fā)生率＞20%） CNA片段共6個(gè)，均為丟失片段：16p

4、13.3-13.2、16p13.11、16q11.2-22.1、16q22.1、16q22.2-24.2和16q24.2。生存分析顯示，僅16q22.1丟失與 HCC術(shù)后肝內(nèi)復(fù)發(fā)顯著相關(guān)（Log-rank檢驗(yàn)，P=0.025）。多因素 Cox回歸分析顯示，16q22.1丟失是肝內(nèi)復(fù)發(fā)的獨(dú)立危險(xiǎn)因素（HR=2.32,95%CI=1.26～4.27，P=0.007）。
　　2．在 HCC復(fù)發(fā)相關(guān)16q22.1片段內(nèi)，有21個(gè)基因（FA

5、M96B、CBFB、C16 orf70、TRADD、ELMO3、TMEM208、ATP6 V0 D1、FAM65 A、CTCF、GFOD2、RANBP10、THAP11、NUTF2、EDC4、PSMB10、DDX28、DUS2L、NFATC3、ESRP2、SLC7 A6和 SLC7 A6 OS）的mRNA表達(dá)水平在16 q22.1丟失HCC組顯著低于無(wú)丟失 HCC組（FDR-q<0.05，P≤0.001）。
　　結(jié)論：