不同環(huán)境海洋放線菌多樣性研究及2株放線菌新菌的分類鑒定.pdf_第1頁
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1、中國海洋大學博士學位論文不同環(huán)境海洋放線菌多樣性研究及2株放線菌新菌的分類鑒定姓名:常顯波申請學位級別:博士專業(yè):海洋生物學指導教師:張曉華2011063北極海洋沉積物中放線菌的分離培養(yǎng)與活性篩選:利用6種培養(yǎng)基(MI~M3、M6M8)從北極海洋沉積物中共分離出109株放線菌,選取34株代表菌株進行16SrDNA測序分析,結果表明它們分別屬于鏈霉菌屬(Streptomyces)、假諾卡氏菌屬(Pseudonocardia)和擬諾卡氏菌屬

2、(Nocardiopsis),其中Streptomyces屬為優(yōu)勢菌屬;不同培養(yǎng)基獲得的放線菌種屬數(shù)量有較大不同,培養(yǎng)基M7分離得到的放線菌種類和數(shù)量較多;在109株放線菌中,有39株對病原菌有抑菌活性。4青島泊子鹽場放線菌分離培養(yǎng):利用3種培養(yǎng)基(MIOM12)從青島即墨市田橫鎮(zhèn)泊子鹽場鹽池底泥樣品中共分離純化出15株放線菌。對分離菌株進行16SrDNA測序分析,發(fā)現(xiàn)這15株放線茵分別屬于鏈霉菌屬(Streptomyces)、擬諾卡氏

3、菌屬(Nocardiopsis)和一個新屬,其中Streptomyces屬為優(yōu)勢菌屬;菌株CXB832與親緣關系最近的2個細菌標準菌株的同源性分別為954%和949%,可以初步判定該菌株為海洋放線菌新屬新種。培養(yǎng)基及培養(yǎng)溫度對鹽池環(huán)境中放線菌的分離效果均有影響,利用培養(yǎng)基M11在37。C分離的放線菌種類和數(shù)量較多。在15株放線菌中,分別有12株、3株、2株和l株放線菌產(chǎn)淀粉酶、產(chǎn)酯酶、蛋白酶和纖維素酶。5耐堿刺孢放線菌新屬新種的分類鑒定

4、:菌株CXB654。o分離自黃海冷水團沉積物中,該菌基內菌絲有分支,不斷裂,氣生菌絲分化成長孢子鏈,孢子呈橢圓形,孢子表面有刺突,生長需要NaCI,核糖和葡萄糖是細胞壁特征糖。16SrDNA序列比對結果顯示,菌株CXB6541與MurinocardiopsisflavidaDSM453121、ThermobifidahalotoleransYIM90462T、MarinactinosporathermotoleransDSM451541

5、最為接近,同源性分別為966%、965%和961%,但在NJ和ML系統(tǒng)進化樹上形成獨立分支。綜合該菌在生理生化特征、16SrDNA同源性和化學指標等方面的實驗結果,可以確定CXB6541菌株是擬諾卡氏菌科(Nocardiopsaceae)中的一個新屬,命名為耐堿刺孢放線菌屬(Spinactinosporaalkalitoleransgennovspnov)。菌株CXB654’在兩個不同國家的菌種保藏中心的保藏號為DSM454141和LM

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