胡蘿卜軟腐歐文氏菌黑脛亞種蛋白質相互作用網絡預測.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、胡蘿卜軟腐歐文氏菌黑脛亞種(Eca1043)專一性感染馬鈴薯導致其發(fā)病，且造成很大的經濟損失。目前越來越多的研究旨在探究其致病機制，想從根本上防治該軟腐病。在本研究中，我們運用了兩種預測蛋白質相互作用的方法（直系同源法和結構域組合法）及一種驗證方法（K最近鄰算法），構建了胡蘿卜軟腐菌歐文氏菌黑脛亞種(Eca1043)的蛋白質-蛋白質相互作用(PPI)網絡。
　　 預測得到的胡蘿卜軟腐菌Eca1043PPI網絡共包含2370個蛋白

2、質及31692對相互作用。我們從網絡的拓撲結構出發(fā)證實了網絡具有較高的可靠性。除此之外，我們還對網絡的基本屬性以及一些重要子網絡進行了后續(xù)分析，具體從分泌系統(tǒng)網絡、鞭毛合成以及趨化系統(tǒng)相關子網絡、信號轉導網絡著手，對Eca1043的PPI網絡進行生物學功能分析。分析發(fā)現，在胡蘿卜軟腐菌Eca1043中，Ⅱ型分泌系統(tǒng)通過控制重要酶類（蛋白酶和裂解酶）的分泌，直接影響其致病性。除了分泌系統(tǒng)外，我們還發(fā)現鞭毛蛋白FliM和FliN是重要的鞭毛

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