亞洲香菇系統(tǒng)發(fā)育學(xué)地位的重新評(píng)估與遺傳多樣性分析.pdf

1、華中農(nóng)業(yè)大學(xué)博士學(xué)位論文亞洲香菇系統(tǒng)發(fā)育學(xué)地位的重新評(píng)估與遺傳多樣性分析姓名：徐學(xué)鋒申請(qǐng)學(xué)位級(jí)別：博士專業(yè)：微生物學(xué)指導(dǎo)教師：林芳燦20050701個(gè)形念種，而譜系v卻與澳洲群體的系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系更近，這也剛好與“東半球的三個(gè)形態(tài)學(xué)種相互交配可親和”的結(jié)論吻合表明分子系統(tǒng)學(xué)與傳統(tǒng)形態(tài)分類之間可以相互佐證；亞洲群體中譜系V的特殊性預(yù)示著可以將其另立為一個(gè)新種，是否可行尚待深入研究5多樣性中心的確立：在全球Lentinula屬的7個(gè)(或者說8個(gè)

2、)譜系中，中國既擁有菌株數(shù)量眾多的島嶼一大陸型譜系I，還擁有惟一的大陸型譜系v，而且譜系I還有進(jìn)一步分化成兩個(gè)譜系的趨勢(shì)無論是從譜系的數(shù)量，譜系的類型還是菌株的分布范圍上考慮，中國(或者說是亞洲)都是Lentinula屆重要的遺傳多樣性中心，對(duì)形態(tài)學(xué)種厶edodes而言，就更是如此6。分子鐘檢驗(yàn)和分歧時(shí)間的估計(jì)：從7個(gè)(或者說8個(gè))不同的譜系中分別抽取部分代表菌株，以金錢菌為外類群構(gòu)建系統(tǒng)樹，以似然比法檢驗(yàn)分子鐘，發(fā)現(xiàn)11rs不具各進(jìn)化

3、速率一致性，拒絕分子鐘假說但是仍舊以它估計(jì)支長，結(jié)合前人的研究結(jié)果校正分歧時(shí)間，發(fā)現(xiàn)亞洲主流譜系l與其它譜系的分歧(節(jié)點(diǎn)D)發(fā)生在420萬年左右；譜系1分化成h和Ib的時(shí)間大約在39萬年左右；以美洲與歐亞大陸分離的時(shí)間和新西蘭與澳洲分離的時(shí)間作為校正點(diǎn)，粗略估計(jì)幾個(gè)重要節(jié)點(diǎn)的分歧時(shí)間有較大差異()群體遺傳分析：1以亞洲群體為主的東半球Lentinula屬不同聚群的劃分及多樣性區(qū)域的確立t由于亞洲菌株都界定為形態(tài)學(xué)種Lentinulaed

4、odes，以前述系統(tǒng)發(fā)育分析方法構(gòu)建亞洲范圍內(nèi)的系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系，將亞洲群體確立為3個(gè)不同的譜系，根據(jù)不同地域菌株在不同譜系中的分布可以將亞洲菌株分成東北亞、西北高原、西南高原、東部沿海和泛中南等5個(gè)群體結(jié)合巴新和澳洲及新西蘭的2個(gè)群體進(jìn)行綜合分析發(fā)現(xiàn)，‘中國西北高原、西南高原、東部沿海和巴一澳等4個(gè)群體涵蓋的譜系數(shù)多，遺傳多樣性相對(duì)更為豐富，其中中國西南最為突出2。群體遺傳格局：對(duì)5個(gè)亞洲群體和2個(gè)澳洲群體進(jìn)行綜合分析，發(fā)現(xiàn)中國西南群體的

5、核苷酸多樣度最高，其次為巴一澳，西北和泛中南等3個(gè)群體，東部沿海群體最低群體問的關(guān)系顯示t西南群體與東北、東部沿海、泛中南和西北等4個(gè)群體的遺傳分化相當(dāng)，遺傳距離接近；西北群體與西南群體的關(guān)系相對(duì)密切，與巴一澳和新西蘭群體的關(guān)系緊密程度較次于西南，而與東北、東部沿海和泛中南的關(guān)系則相對(duì)更遠(yuǎn)一些；巴一澳和新西蘭群體與東北，東部沿海和泛中南等群體的關(guān)系最遠(yuǎn)；需要關(guān)注的是巴一澳和新西蘭群體與中國西北群體的關(guān)系相對(duì)更為密切，但地緣關(guān)系卻很遠(yuǎn)3演