轉(zhuǎn)錄因子ZmNAM056調(diào)控玉米淀粉合成相關(guān)基因表達(dá)的初探.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、玉米(Zea mayL.)是世界第一大糧食作物,種植面積和產(chǎn)量均居三大糧食作物之首,玉米淀粉也是各種植物淀粉中化學(xué)成分最佳的淀粉之一。如今,隨著世界人口的日益增加,資源及耕地面積的日益減少,對作物產(chǎn)量及品質(zhì)的要求也就越來越高。
  淀粉的生物合成過程的核心包括ADPG的合成,多糖鏈的延伸,多糖鏈的的分支,多糖鏈的去分支。淀粉的生物合成是一個十分復(fù)雜的過程,是在一系列酶的共同催化下完成的,在籽粒胚乳中淀粉合成的最后階段涉及四類非常關(guān)

2、鍵的酶類:腺苷二磷酸葡萄糖焦磷酸化酶(ADP-glucose pyrophosphorylase,AGPase)、淀粉合成酶(Starch synthase,SS)、淀粉分支酶(Starch branching enzyme,SBE)和淀粉去分支酶(Starch debranching enzyme,DBE)。目前對于淀粉相關(guān)合成酶的功能研究做得相對成熟,但對于淀粉合成相關(guān)酶的上游調(diào)控機(jī)制研究,即淀粉合成相關(guān)酶的順式作用元件和反式作用因

3、子的研究報道較少。
  我們根據(jù)文獻(xiàn)報道和現(xiàn)有基因資源選取在玉米胚乳中特異表達(dá)或高表達(dá)的參與淀粉合成關(guān)鍵酶編碼的8個基因:Sh2、Bt2、SSⅠ、SSⅡa、SSⅢa、sbe1、sbeⅡb、Isa1。課題組前期通過RNA-seq測定玉米籽粒灌漿時期不同關(guān)鍵點(diǎn)胚乳RNA表達(dá)譜,篩選了可能參與玉米胚乳淀粉合成的轉(zhuǎn)錄因子;同時利用公共數(shù)據(jù)庫通過共相關(guān)分析、篩選與上述8個淀粉合成相關(guān)基因表達(dá)相關(guān)的轉(zhuǎn)錄因子,取相關(guān)系數(shù)極高的轉(zhuǎn)錄因子列為候選轉(zhuǎn)

4、錄因子。我們比較通過這兩種方法篩選到的候選轉(zhuǎn)錄因子,發(fā)現(xiàn)了一個共同的NAC家族的轉(zhuǎn)錄因子,并命名為ZmNAM056。在此基礎(chǔ)之上采用半定量RT-PCR或熒光定量PCR、基因瞬時表達(dá)、酵母單雜交以及亞細(xì)胞定位繼續(xù)驗(yàn)證篩選的轉(zhuǎn)錄因子對淀粉合成關(guān)鍵酶基因表達(dá)的調(diào)控作用,具體結(jié)果如下:
  1、以玉米優(yōu)良骨干自交系B73為實(shí)驗(yàn)材料,我們成功從玉米胚乳中克隆到該轉(zhuǎn)錄因子,該基因含有一個編碼391個氨基酸的開放閱讀框。其他植物氨基酸序列進(jìn)行同

5、源比對,發(fā)現(xiàn)ZmNAM056轉(zhuǎn)錄因子含有NAC轉(zhuǎn)錄因子特有的N端DNA結(jié)合結(jié)構(gòu)域和C端轉(zhuǎn)錄激活結(jié)構(gòu)域。
  2、對ZmNAM056基因表達(dá)模式進(jìn)行了分析。半定量PCR結(jié)果表明ZmNAM056基因在籽粒中特異表達(dá);隨后實(shí)時熒光定量PCR,結(jié)果表明ZmNAM056基因在授粉后前7天的籽粒中表達(dá)量較低,授粉后10天開始大量表達(dá),授粉后20天達(dá)到最高,并且發(fā)現(xiàn)同玉米胚乳淀粉合成相關(guān)基因表現(xiàn)出極強(qiáng)的正相關(guān)。同時還研究了不同糖類和植物激素對胚

6、乳淀粉合成相關(guān)基因及ZmNAM056基因表達(dá)的影響,結(jié)果發(fā)現(xiàn)其中AGPase基因Brittle-2、Shrunken-2在所處理?xiàng)l件下其表達(dá)趨勢是一致的,都受Glu、Suc、ABA的誘導(dǎo),F(xiàn)ru、Tre的抑制;淀粉合成酶類(SSs)基因,SSⅡa受Glu的顯著誘導(dǎo),卻不受ABA的誘導(dǎo),SSⅢa受ABA的顯著誘導(dǎo),卻不受Glu的誘導(dǎo),SSⅠ受Glu跟ABA的顯著誘導(dǎo);淀粉合成分支酶類(SBE)基因BEI受Tre、Suc的顯著誘導(dǎo),而SBE

7、Ⅱb受Fru、Glu的顯著誘導(dǎo)。這些結(jié)果說明同一個基因在不同處理?xiàng)l件下,其表達(dá)是有很大差異的,不同基因在相同條件處理時,有些基因的表達(dá)趨勢是一致的,而有些表達(dá)趨勢又是有差異的。其中蔗糖、葡萄糖、ABA對這些基因的表達(dá)影響較大。ZmNA M056基因的表達(dá)卻不受蔗糖的影響;激素ABA跟葡萄糖促進(jìn)ZmNAM056基因的表達(dá),有趣的是蔗糖跟ABA協(xié)同處理時,促進(jìn)效果更明顯。
  3、構(gòu)建35S∷ZmNAM-GFP融合蛋白表達(dá)載體,通過基

8、因槍轟擊介導(dǎo)洋蔥表皮細(xì)胞進(jìn)行亞細(xì)胞定位,結(jié)果表明Zm NA M056編碼蛋白定位于細(xì)胞核中;通過酵母轉(zhuǎn)化實(shí)驗(yàn)分析表明,ZmNAM056基因編碼蛋白具有轉(zhuǎn)錄激活性。同時克隆玉米ZmNAM056蛋白的編碼序列連接入pET-28載體,在大腸桿菌RosettaTM(DE3)菌株中進(jìn)行原核表達(dá),然后通過Ni-Agarose柱純化6×His-ZmNAM056融合蛋白。
  4、通過基因槍轟擊介導(dǎo)玉米胚乳的瞬時表達(dá)實(shí)驗(yàn)以及酵母單雜交實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證轉(zhuǎn)錄

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