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文檔簡介
1、單核苷酸多態(tài)性(SNP)是指在基因組上單個核苷酸的變異,是DNA 多態(tài)性的一種最普遍的類型。因為大量存在著SNP 位點并且不同的SNP組成致病模型與疾病之間存在著關聯(lián)關系,這使人們有機會發(fā)現(xiàn)與各種疾病相關的基因組突變,現(xiàn)在普遍認為SNP 研究是人類基因組計劃走向應用的重要步驟,所以對SNP的研究具有重要的意義。
本文研究了關聯(lián)分析中SNP與疾病關聯(lián)關系的建模方法。針對不同的致病模型之間存在相互關聯(lián)、交叉影響的情況,我們提出
2、了軟劃分、硬劃分等樣本劃分方法,應用這些方法進行解交叉(decrossing)工作,同時使用MLP(多層感知器)
神經網絡建立模型。通過使用真實SNP 數(shù)據進行實驗,求解出每個致病模型的真實致病概率,并將實驗結果與真實模型進行比較分析,以驗證方法的正確性。由于樣本數(shù)據以及神經網絡本身會存在一些不足,我們采用Bootstrap 方法對樣本數(shù)據進行泛化處理,實驗結果表明使用此方法可以有效提高神經網絡的訓練正確率。
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