玉米自交系萌發(fā)特性的評價及SNP關聯分析.pdf

1、本研究通過室內重復可靠的萌發(fā)試驗，篩選玉米自交系萌發(fā)期干旱脅迫和鹽脅迫條件下的鑒定指標，建立快速可靠地玉米自交系萌發(fā)期抗旱性、抗鹽性評價體系，對培育優(yōu)良的雜交種、穩(wěn)定玉米生產具有重要意義。同時，選用172份玉米自交系為材料，篩選得到均勻分布于玉米10條染色體上的SNP標記，分析玉米自交系的遺傳結構和群體結構，用關聯分析的方法篩選與玉米自交系萌發(fā)性狀相關聯的分子標記。
　　1.根據對15％PEG干旱脅迫處理與CK的各指標分析，篩選出

2、用于評價干旱脅迫條件下玉米自交系萌發(fā)特性指標:相對發(fā)芽率及相對活力指數在權重系數分別為0.6和0.4時，聚類結果最好，自交系可以分為高抗、抗、中抗、低抗、不抗5大類;根據聚類后各類型的特性，建立了玉米萌發(fā)期間抗旱能力評價的判別函數:Y=0.6RGR+0.4RVI，建立的判別函數可對玉米自交系萌發(fā)時期的抗旱性進行評價與篩選。
　　2.根據對0.8％NaCl鹽脅迫處理與CK的各指標分析，篩選出用于評價鹽脅迫條件下玉米自交系萌發(fā)特性指標

3、:相對發(fā)芽率及相對活力指數在權重系數分別為0.6和0.4時，聚類結果最好，自交系可以分為高抗、抗、中抗、低抗、不抗5大類;根據聚類后各類型的特性，建立了玉米萌發(fā)期間耐鹽能力評價的判別函數:Y=0.6RGR+0.4RVI，建立的判別函數可對玉米自交系萌發(fā)時期的耐鹽性進行評價與篩選。
　　3.從56，110個SNP標記中篩選獲得35171個具有高質量和多態(tài)性SNP標記，堿基變化涉及A/C(4231)、A/G(14138)、A/T(24

4、3)、T/A(212)、T/C(12054)、T/G(3676)、C/G(353)、G/C(264)8種，其中A/G類型最多，在所有類型中占40.20％，第1號染色體分布最多，為4926個SNP，占總標記數多的14.01％，其余染色體分布范圍在6.04％-12.45％。
　　4.利用35171個SNP標記對238個自交系連鎖不平衡分析表明，關聯分析群體有很高的連鎖不平衡水平，但不同染色體上衰減距離差異較大。6號染色體的衰減距離最小

5、僅為0.66 Kb，1、3、4、7、9和10號染色體的衰減距離在2.139 Kb至6.186 Kb之間，2、5、7號染色體的衰減距離均大于10 Kb，其中2號染色體的衰減距離最大達到22.384 Kb。
　　5.遺傳結構分析將172個自交系可分為塘四平頭群、P群、改良Reid和其它4個類群。其它群多為我國近10年引入國外新種質的改良系，對該類群種質遺傳特性和種質類群特性的深入研究或將會為以后的玉米遺傳育種起到重要的指導作用。

6、>　　6.基于MLM的關聯分析表明，在考慮群體結構的情況下，在P≤0.001水平下，干旱脅迫條件下與相對發(fā)芽率、相對活力指數、綜合指標關聯SNP標記分別為20、53、41個;鹽脅迫條件下與相對發(fā)芽率、相對活力指數、綜合指標關聯SNP標記分別為分別為15、8、11個;在干旱脅迫條件下有16個SNP標記同時與兩個性狀關聯，有1個SNP標記同時與三個性狀關聯;在鹽脅迫條件下有11個SNP標記同時與兩個性狀關聯，有3個SNP標記同時與三個性狀關