侵染煙草的四個(gè)馬鈴薯Y病毒分離物基因組序列比較分析.pdf

1、馬鈴薯Y病毒(PotatovirusY,PVY)是危害馬鈴薯和煙草的重要病毒,嚴(yán)重影響馬鈴薯和煙草生產(chǎn)。國外已有大量關(guān)于侵染馬鈴薯的PVY病毒特性和株系多樣性的研究,然而國內(nèi)外關(guān)于侵染煙草的PVY的研究甚少,對于廣西的研究更是空白。本研究對侵染廣西煙草并引起煙草脈壞死的分離物GX-1、GX-2、GX-3及引起煙草系統(tǒng)性斑駁的分離物GX-4的血清學(xué)和全長序列進(jìn)行了測定。血清學(xué)鑒定結(jié)果表明這四個(gè)分離物均與PVYO+C抗體呈陽性反應(yīng)。利用RT

2、-PCR方法分段克隆了四個(gè)PVY分離物全長基因組序列,除了3’末端poly(A)尾巴,GX-1全長9699nt,GX-2和GX-4全長9702nt,GX-3全長9703nt,四個(gè)分離物基因組均含有一個(gè)大的開放閱讀框,均編碼由3061個(gè)氨基酸組成的多聚蛋白,這一多聚蛋白被3個(gè)蛋白酶分成10個(gè)功能蛋白。通過對全基因組核苷酸的同源性比較分析,GX-1、GX-2、GX-3和GX-4與20個(gè)已報(bào)道PVY分離物的核苷酸同源性分別在89.8％～98.

3、6％、88.4％～99.7％、88.5％～99.7％和89.3％～96.1％之間。GX-1、GX-2和GX-3的Hc-Pro上均含有控制PVY在煙草上引起壞死癥狀的D205、K400和E419氨基酸,但GX-4的Hc-Pro上400位氨基酸為R。重組分析發(fā)現(xiàn)GX-1、GX-2和GX-3均是普通株系(PVFO)和煙草脈壞死株系(PVYN)分離物的重組體,GX-1具有4個(gè)重組位點(diǎn),分別位于P1蛋白,He-Pro/P3、6K2/VPg及Nib