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1、本論文主要采用電噴霧質(zhì)譜法對(duì)細(xì)胞色素C及其非共價(jià)鍵復(fù)合物進(jìn)行定性和定量研究。因電噴霧質(zhì)譜法具有多電荷能力,所以其在分析大分子物質(zhì)方面有著獨(dú)特的優(yōu)勢(shì)。此外,電噴霧質(zhì)譜法所具有的快速、特異性、靈敏的特點(diǎn)促使其在眾多學(xué)科和領(lǐng)域中得到廣泛應(yīng)用。電噴霧質(zhì)譜法作為一種軟電離方式,其對(duì)于非共價(jià)鍵復(fù)合物的研究有著不可替代的地位。其不僅能夠在比較溫和的條件下保持復(fù)合物結(jié)構(gòu)的穩(wěn)定性,而且能夠容易得出非共價(jià)鍵復(fù)合物的分子量、化學(xué)計(jì)量比等具體信息。
2、 在電噴霧質(zhì)譜法中,待測(cè)樣品信號(hào)強(qiáng)度受儀器參數(shù)的影響比較明顯。合適的參數(shù)條件不僅要求樣品的信號(hào)強(qiáng)度要足夠強(qiáng),而且還需盡可能選擇較溫和的條件,這樣有助于保持蛋白質(zhì)及非共價(jià)鍵復(fù)合物的天然構(gòu)型。本課題考察各個(gè)儀器參數(shù)對(duì)信號(hào)強(qiáng)度的影響,探索獲得了研究細(xì)胞色素C復(fù)合物的最佳實(shí)驗(yàn)條件。并且利用改變碰撞電壓的方法,通過(guò)二級(jí)質(zhì)譜證明了細(xì)胞色素C中血紅素與氨基酸殘基的結(jié)合方式是以穩(wěn)定的共價(jià)鍵形式存在。
本文選取三類不同的小分子物質(zhì)(皂苷、
3、寡糖和三萜)與細(xì)胞色素C混合并運(yùn)用ESI-MS來(lái)檢測(cè)是否形成非共價(jià)鍵復(fù)合物。通過(guò)實(shí)驗(yàn)結(jié)果證明細(xì)胞色素C能與皂苷(柴胡皂苷A、柴胡皂苷C、人參皂苷Re)形成非共價(jià)鍵復(fù)合物;根據(jù)皂苷在分子結(jié)構(gòu)上是由寡糖和三萜兩部分構(gòu)成,先后選擇三種寡糖(水蘇糖、綿子糖、麥芽三糖)和三種三萜(甘草次酸、齊墩果酸、熊果酸)與細(xì)胞色素C進(jìn)行混合,根據(jù)質(zhì)譜檢測(cè)出結(jié)果顯示三種寡糖都能與細(xì)胞色素C形成非共價(jià)鍵復(fù)合物;而檢測(cè)結(jié)果未觀察到三種三萜與細(xì)胞色素C形成的非共價(jià)鍵
4、復(fù)合物。上述研究說(shuō)明在與細(xì)胞色素C形成非共價(jià)鍵復(fù)合物的過(guò)程中,皂苷的有效結(jié)合區(qū)域在寡糖部分而非三萜部分。本課題是已知目前首次采用電噴霧質(zhì)譜法研究寡糖作為配體與細(xì)胞色素C形成的非共價(jià)鍵復(fù)合物,證明了電噴霧質(zhì)譜法在對(duì)細(xì)胞色素C及其非共價(jià)鍵復(fù)合物的研究方面所具有的獨(dú)特優(yōu)勢(shì),而且為細(xì)胞色素C非共價(jià)鍵復(fù)合物的配體選擇方面提供了新的思路。
本課題不但通過(guò)定性研究證明了皂苷和寡糖都能與細(xì)胞色素C形成非共價(jià)鍵復(fù)合物,而且通過(guò)特定的直接計(jì)算
5、法對(duì)所形成的非共價(jià)鍵復(fù)合物的穩(wěn)定性進(jìn)行了定量計(jì)算。本課題中采用特定的直接計(jì)算法,計(jì)算出皂苷(柴胡皂苷A、柴胡皂苷C、人參皂苷Re)、寡糖(水蘇糖、綿子糖、麥芽三糖)分別與細(xì)胞色素C形成的1:1、1:2非共價(jià)鍵復(fù)合物的解離常數(shù)Kd1、Kd2,并根據(jù)解離常數(shù)大小比較了皂苷、寡糖分別與細(xì)胞色素C形成非共價(jià)鍵復(fù)合物的穩(wěn)定性的相對(duì)大小。
本課題通過(guò)直接實(shí)驗(yàn)法來(lái)探究細(xì)胞色素C與配體分子的結(jié)合部位和作用方式;根據(jù)計(jì)算所得的解離常數(shù),并結(jié)
6、合配體結(jié)構(gòu)和已知的文獻(xiàn),我們對(duì)于各種配體形成非共價(jià)鍵復(fù)合物的穩(wěn)定性差別給予了詳細(xì)、明確的解釋。根據(jù)質(zhì)譜檢測(cè)結(jié)果和配體的結(jié)構(gòu)以及相關(guān)的參考文獻(xiàn),得知配體與細(xì)胞色素C是以氫鍵的形式形成了非共價(jià)鍵復(fù)合物。配體分子中羥基的個(gè)數(shù)對(duì)非共價(jià)鍵復(fù)合物的穩(wěn)定性具有重要的正相關(guān)性;此外,配體結(jié)構(gòu)以及空間位阻對(duì)于非共價(jià)鍵復(fù)合物的形成也是有一定的影響。
不同于文獻(xiàn)報(bào)道的理論計(jì)算法,本實(shí)驗(yàn)課題采用細(xì)胞色素C作為模型分子進(jìn)行電噴霧質(zhì)譜檢測(cè),并選擇配體
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