國家自然基金標(biāo)書-蛋白質(zhì)組海量質(zhì)譜數(shù)據(jù)的解析及其在人類基因組注釋中的應(yīng)用

1、項目名稱： 蛋白質(zhì)組海量質(zhì)譜數(shù)據(jù)的解析及其 蛋白質(zhì)組海量質(zhì)譜數(shù)據(jù)的解析及其在人類基因組注釋中的應(yīng)用 在人類基因組注釋中的應(yīng)用首席科學(xué)家： 劉斯奇 劉斯奇 中國科學(xué)院北京基因組研究 中國科學(xué)院北京基因組研究所起止年限： 2010 2010 年 1 月-2014 -2014 年 8 月依托部門： 中國科學(xué)院 中國科學(xué)院采用 De Novo 方法獨立演繹所測定肽段的氨基酸順序，進一步反轉(zhuǎn)肽段信息至基因組，試圖補充和修訂基因組的蛋白質(zhì)編碼基因

2、，具體研究：? 構(gòu)建綜合性蛋白質(zhì)序列數(shù)據(jù)庫；? 建立基于肽段信息注釋基因組的方法流程；? 利用 MS/MS 所鑒定的肽段補充和修訂基因組蛋白質(zhì)編碼基因。3．基于高精度質(zhì)譜數(shù)據(jù)的蛋白質(zhì)表達(dá)譜 基于高精度質(zhì)譜數(shù)據(jù)的蛋白質(zhì)表達(dá)譜定量計算方法的研究及應(yīng)用 定量計算方法的研究及應(yīng)用以鑒定的肽段頻率為基礎(chǔ)，發(fā)展兼顧準(zhǔn)確度與規(guī)?；姆菢?biāo)記定量蛋白質(zhì)學(xué)方法，同時開發(fā)以多肽質(zhì)譜數(shù)據(jù)為基礎(chǔ)的蛋白質(zhì)編碼基因的可視化標(biāo)識技術(shù)，實現(xiàn)蛋白質(zhì)表達(dá)譜的定量化，具

3、體研究：? 蛋白質(zhì)表達(dá)譜定量算法研究；? 蛋白質(zhì)組表達(dá)譜定量分析及可視化研究；? 建立以基因為中心的定量蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫及分析平臺。4． 基于質(zhì)譜數(shù)據(jù)的預(yù)測結(jié)論的實驗驗證研究 基于質(zhì)譜數(shù)據(jù)的預(yù)測結(jié)論的實驗驗證研究運用質(zhì)譜學(xué)、生物化學(xué)、分子生物學(xué)和免疫學(xué)等手段系統(tǒng)驗證基于 MS/MS 數(shù)據(jù)所分析的生物信息學(xué)結(jié)論，同時為生物信息學(xué)的理論模型提供嚴(yán)格設(shè)計和控制的實驗數(shù)據(jù)，具體研究：? 建立先進的MRM技術(shù)平臺實現(xiàn)對蛋白質(zhì)定性和定量的高通量