藥學(xué)信息資源獲取和利用

1、藥學(xué)信息資源獲取和利用,解放軍醫(yī)學(xué)圖書館學(xué)科化服務(wù)部 王蕭,一、綜合性醫(yī)藥學(xué)數(shù)據(jù)庫二、藥物化學(xué)相關(guān)的數(shù)據(jù)庫三、網(wǎng)絡(luò)資源四、其它資源及工具書,目 錄,藥學(xué)是以各種科學(xué)為基礎(chǔ)來研究藥物的知識系統(tǒng)。信息檢索，簡單來說就是從信息的集合中找到所需信息的過程。而藥學(xué)信息的集合涵蓋了藥物研制、生產(chǎn)、流通、使用和管理的各個方面，因此具有一定的復(fù)雜性。從資源類型區(qū)分，藥學(xué)信息包括圖書、期刊文獻、專利、產(chǎn)品信息等；從資源性質(zhì)區(qū)分，

2、有數(shù)據(jù)庫資源、網(wǎng)絡(luò)資源、紙本資源等；從專業(yè)角度區(qū)分，分為藥理、藥分、藥化、藥劑、藥物流行病學(xué)等。,文摘數(shù)據(jù)庫： （1）Embase （2）Pubmed（3）國際藥學(xué)文摘（4）德溫特藥學(xué)文檔,一、綜合性醫(yī)藥學(xué)數(shù)據(jù)庫,全文數(shù)據(jù)庫： （1）ADIS藥學(xué)電子期刊全文數(shù)據(jù)庫（2）Clinical Pharmacology臨床藥理學(xué)數(shù)據(jù)庫（事實數(shù)據(jù)）,1.1 EmbaseEmbase（Excerpt Medical Database

3、，http://www.embase.com）是藥物和生物醫(yī)藥的綜合數(shù)據(jù)庫，由荷蘭Elsevier Science出版公司建立。Embase包含的內(nèi)容涉及藥學(xué)、臨床醫(yī)學(xué)、基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)、預(yù)防醫(yī)學(xué)和生物醫(yī)學(xué)工程等，其中40%左右為藥物文獻信息，在檢索的時候可以與PubMed互補使用。,,1.1.1 綜合檢索,,,1.1.2 藥物檢索 簡單檢索，如：“l(fā)ow molecular weight heparin”，系統(tǒng)規(guī)定對輸入的

4、詞組或短語必須加上引號（單引號和雙引號均可）。該同時支持“*”和“？”截詞符、“NEXT/n”和“NEAR/n”近似運算符及布爾邏輯運算符。 在檢索框中鍵入需要搜索的藥物名（generic name）、專利商品名（proprietary name）、實驗室代碼（laboratory code）和化學(xué)名（chemical name）來檢索相關(guān)藥物信息。,,Embase還可以提示用戶將輸入的檢索詞轉(zhuǎn)化為合適的優(yōu)選術(shù)語或藥物名稱或

5、主題詞。如：在“Drug ”搜索欄中輸入：藥物的商品名claritin克敏能，系統(tǒng)提供自動識別和匹配功能，提供該藥物的化學(xué)名loratadine。,,如果需要查詢與某代號相應(yīng)的藥物主題詞，可在Drug檢索欄中直接輸入代號，如：sch29851，系統(tǒng)會提示用戶“use：loratadine”。,,,在藥物檢索的界面，針對檢索需要還增加了17種藥物副主題詞（Drug Subheading）和47種給藥途徑（Route）的限定選項。,,如

6、何提高查準(zhǔn)率？,如果使用主題詞合并副主題詞等檢索限制條件，將大大提高查準(zhǔn)率。如單獨檢索“l(fā)oratadine”（氯雷他定），系統(tǒng)會出現(xiàn)5543條Records；檢索“l(fā)oratadine”并在“Drug Subheading”中勾選“Clinical trial”，系統(tǒng)則返回505條Records，檢索“l(fā)oratadine”并在“Route”中勾選“Oral drug administration”，系統(tǒng)則返回553條Reco

7、rds.,,檢索結(jié)果的二次篩選：在界面左側(cè)有一列“Results Filters”，將5543Records按不同的分類標(biāo)準(zhǔn)劃分。如查找loratadine與臨床實驗有關(guān)的檢索結(jié)果，在“Study Types”中勾選“clinical trial”，可以看到1071篇相關(guān)文獻。,,,,需要注意的是，要將“Results Filters”和“Drug Subheading”的功能區(qū)分清楚?！癛esults Filters”僅僅是對已

8、經(jīng)完成的檢索結(jié)果進行一個簡單的分類，分類的標(biāo)準(zhǔn)并不嚴(yán)謹(jǐn)。而“Drug Subheading”是系統(tǒng)嚴(yán)格制定的副主題詞，在文獻檢索結(jié)果給出之前進行篩選，目的是提高用戶的查準(zhǔn)率。,國際藥學(xué)文摘（International Pharmaceutical Abstracts,簡稱“IPA”）由美國醫(yī)院藥師協(xié)會出版。IPA 數(shù)據(jù)庫主要用于檢索和顯示藥學(xué)文獻，范圍包括藥物臨床和技術(shù)信息、藥學(xué)實踐、藥學(xué)教育以及相關(guān)的法律法規(guī)。IPA 數(shù)據(jù)庫：美

9、國醫(yī)藥衛(wèi)生協(xié)會(ASHP) 的論文文摘(1998年——） 美國藥學(xué)協(xié)會(APhA)推薦的論文文摘 美國藥學(xué)學(xué)院協(xié)會(AACP)年會推薦的論文文摘 IPA 另一特點是，它既包括了美國所有州的藥學(xué)期刊，又包括了大部分化妝品出版物。,1.2 國際藥學(xué)文摘,IPA分類采用美國醫(yī)院藥典(American Hospital Formula

10、ry Service，AHFS) 。數(shù)據(jù)庫中藥物術(shù)語，是由美國醫(yī)院藥劑師學(xué)會(American Society of Hospital Pharmacists)公布，AHFS 確定種類。如果需要檢索藥物學(xué)或治療學(xué)，需要在檢索詞后面加上字段標(biāo)識。格式為：“分類號.pc”或“藥物類別.pc”。,,DDF由德溫特公司推出，涵蓋1983年至今幾乎所有藥學(xué)文獻，年收錄文獻約10萬條，數(shù)據(jù)來源于大約1200種科學(xué)出版物，包括世界范圍內(nèi)的期刊和

11、會議錄。新藥的所有資料均予收錄，而常規(guī)藥的一般資料如病例報告、討論、社論和述評等則不予收錄，除非論文中有重大發(fā)現(xiàn)如副反應(yīng)等。綜述文獻一般選擇那些對藥物進行了詳細的討論和引用文獻較多的才收錄。,1.3 德溫特藥學(xué)文檔（DDF）,該數(shù)據(jù)庫內(nèi)容涉及藥品發(fā)展、生產(chǎn)制備、評估等方面的資料，包括藥品在分析、生物化學(xué)、化學(xué)、內(nèi)分泌、免疫學(xué)、醫(yī)學(xué)、微生物學(xué)、制藥學(xué)、藥理學(xué)、生理學(xué)、毒理學(xué)等方面的資料。在檢索方面，DDF的特點是，鏈接詞字段(L

12、T)中的藥品或疾病還包含一個修飾詞作用代碼(Role code)。該作用代碼是2個字母的縮寫。用“-”連接在藥品或疾病名稱的后面，如“mitoxantrone-tr”或“asthma-st”對其前面的藥品或疾病進行范圍限定。,,文摘數(shù)據(jù)庫：（1）Reaxys（2）SciFinder,二、與藥物化學(xué)相關(guān)的數(shù)據(jù)庫,全文數(shù)據(jù)庫：（1）ACS 美國化學(xué)會電子期刊（2）RSC 英國皇家化學(xué)學(xué)會（3） Thieme harmaceutic

13、al E-package 化學(xué)與藥學(xué)期刊，Synthesis和Synlett,SciFinder和Reaxys數(shù)據(jù)庫是化學(xué)化工及其相關(guān)領(lǐng)域的兩大重要數(shù)據(jù)庫，首先對二者進行一個對比分析，再分別介紹。,SciFinder包含的數(shù)據(jù)較廣泛，收錄的文獻類型包括期刊、專利評論、會議錄、論文、技術(shù)報告和圖書中的各種化學(xué)研究成果，涉及化學(xué)、藥學(xué)、醫(yī)學(xué)、物理、生命科學(xué)、聚合體學(xué)、材料學(xué)、地質(zhì)學(xué)、食品科學(xué)和農(nóng)學(xué)等諸多學(xué)科領(lǐng)域。,二者收錄范圍對比：,Rea

14、xys中雖然文獻數(shù)據(jù)不及SciFinder全面，但其文獻收錄的時間更長，部分子數(shù)據(jù)庫信息可回溯到1771年，其許多事實數(shù)據(jù)如熔點、沸點等物理和化學(xué)性質(zhì)數(shù)據(jù)更詳細，并有來源摘要，化學(xué)物質(zhì)及反應(yīng)引用的早期文獻記錄數(shù)據(jù)較多，可與SciFinder互補使用。,都含有：結(jié)構(gòu)式檢索、反應(yīng)式檢索、二次檢索,二者功能對比：,區(qū)別：登錄： reaxys是IP綁定模式， scifinder是IP綁定結(jié)合賬號密碼模式。檢索結(jié)果： reaxys是事實數(shù)據(jù)形

15、式， scifinder是文獻列表形式。簡單檢索：reaxys是quick search，scifinder是文獻檢索（含主題檢索、作者名、機構(gòu)名、文獻標(biāo)識符）高級功能： reaxys有反應(yīng)路線設(shè)計功能，scifinder有對檢索結(jié)果的深入分析功能。,Reaxys數(shù)據(jù)庫是由愛思唯爾（Elsevier）公司出品的化學(xué)數(shù)值與事實數(shù)據(jù)庫。Reaxys數(shù)據(jù)庫包括：Beilstein：涵蓋時間范圍從1771年至今；包含化學(xué)結(jié)構(gòu)相關(guān)的化學(xué)

16、、物理等方面的性質(zhì)；Gmelin：涵蓋時間范圍從1772年至今；包含詳細的理化性質(zhì)，以及地質(zhì)學(xué)、礦物學(xué)、冶金學(xué)、材料學(xué)等方面的信息資源。Patent：選自1976年以來有機化學(xué)、藥物（醫(yī)藥、牙醫(yī)、化妝品制備）、生物殺滅劑（農(nóng)用化學(xué)品、消毒劑等）、染料等的英文專利（WO、US、EP）以及化學(xué)相關(guān)期刊的內(nèi)容整合為統(tǒng)一的資源。,2.1 Reaxys,三種檢索方法:（1）Quick Search（2）Create structure o

17、r reaction drawing（3）Query builder,（1）快速檢索欄可以查什么？,（2）如何通過繪制結(jié)構(gòu)，進行檢索,（3）Query builder：相當(dāng)于個性化定制檢索條件 提供Reaxys注冊號、CAS注冊號、化學(xué)名、理化性質(zhì)、光學(xué)性質(zhì)等途徑，可多選。,（4）反應(yīng)路線設(shè)計： 輸入產(chǎn)物結(jié)構(gòu)，查詢，在檢索結(jié)果界面中，點擊“synthesize”。,SciFinder數(shù)據(jù)庫是著名的檢索工具刊—

18、—美國《化學(xué)文摘》的網(wǎng)絡(luò)版，由美國化學(xué)學(xué)會（ACS）旗下的化學(xué)文摘服務(wù)社CAS（Chemical Abstract Service）出版。囊括了自20世紀(jì)以來所有與化學(xué)相關(guān)的資料，以及大量生命科學(xué)及及其它科學(xué)學(xué)科方面的信息。學(xué)科領(lǐng)域覆蓋普通化學(xué)、農(nóng)業(yè)科學(xué)、醫(yī)學(xué)科學(xué)、物理學(xué)、地質(zhì)科學(xué)、生物和生命科學(xué)、工程科學(xué)、材料科學(xué)、聚合物科學(xué)和食品科學(xué)等。,2.2 SciFinder,2.2.1 SciFinder 各數(shù)據(jù)庫（1）CAplus：

19、包含來自 150 多個國家、9000 多種期刊的文獻，覆蓋 1907 年到現(xiàn)在的所有文獻以及部分 1907 年以前的文獻，（2）CAS REGISTRY：化合物信息數(shù)據(jù)庫（3）CHEMLIST：關(guān)于管控化學(xué)品信息的數(shù)據(jù)庫（4）CASREACT：化學(xué)反應(yīng)數(shù)據(jù)庫（5）CHEMCATS：化學(xué)品商業(yè)信息數(shù)據(jù)庫（6）MEDLINE：美國國家醫(yī)學(xué)圖書館（NLM）建立的書目型數(shù)據(jù)庫,,2.2.2 SciFinder 注冊 使用W

20、eb版的用戶需要注冊SciFinder的賬號，使用企業(yè)版的用戶用于注冊的郵箱必須是本單位規(guī)定的統(tǒng)一郵箱，注冊后系統(tǒng)將自動發(fā)送一個鏈接到您所填寫的email郵箱中，在48小時內(nèi)激活即可完成注冊。 注冊完成之后，進入https://scifinder.cas.org/scifinder/login，登錄完成后即可進行檢索。,,,,,文獻檢索,物質(zhì)檢索,反應(yīng)檢索,2.2.3 SciFinder如何使用,（1）文獻檢索（REFER

21、ENCES）,SciFinder的文獻檢索中提供了：主題檢索（Research Topic）、作者名檢索（Author Name）、機構(gòu)名檢索（Company Name）、文獻標(biāo)識符（Document Identifier）等途徑獲得文獻。,在主題檢索中需要注意的是，SciFinder不支持邏輯運算符（and、or、not），檢索詞之間使用介詞鏈接，如：with、at、of 、between等。例：納米材料與耐藥基因,重點

22、,,同義詞,重點,,56,,56,（2）物質(zhì)檢索（SUBSTANCES）,SciFinder的物質(zhì)檢索中提供了：化學(xué)結(jié)構(gòu)檢索（Chemical Structure）Markush檢索分子式檢索（Molecular Formula）理化性質(zhì)檢索（Propety）物質(zhì)名稱檢索（Substance Identifier）,其中化學(xué)結(jié)構(gòu)檢索和Markush檢索需要繪制出待查詢的結(jié)構(gòu)。SciFinder的繪圖板提供Java運行和Non

23、-java運行兩種方式。,C3H6O，C4H8，C5H7N2O,SciFinder的反應(yīng)檢索:精確反應(yīng)檢索（在特定的位點進行取代）模糊反應(yīng)檢索（亞結(jié)構(gòu)檢索，允許有更多的取代情況）。,（3）反應(yīng)檢索（REACTIONS）,（4）主題檢索：結(jié)果的篩選、分析,（4）主題檢索：結(jié)果的篩選、分析,,（1）國家食品藥品監(jiān)督管理總局（2）美國食品和藥物管理局（3）毒理學(xué)網(wǎng)絡(luò)（4）美國藥物不良反應(yīng)監(jiān)測網(wǎng)（5）PharmaWeb,三、網(wǎng)絡(luò)資

24、源,1、國家食品藥品監(jiān)督管理總局（China Food and Drug Administration，CFDA）,國家食品藥品監(jiān)督管理總局是我國食品、藥品、醫(yī)療器械、化妝品的監(jiān)管機構(gòu)，主要負責(zé)起草監(jiān)管的相關(guān)法規(guī)，制定實施辦法、管理制度、稽查制度并監(jiān)督組織實施等。通過CFDA網(wǎng)站（www.sda.gov.cn/）可以查找我國有關(guān)藥品食品的相關(guān)政策文件、注冊/審批信息、公告等。 在CFDA網(wǎng)站首頁的右上角列出了分類管理的入口。

25、,點擊“藥品”，進入CFDA的專題專欄。在子網(wǎng)頁的右上角，有“數(shù)據(jù)查詢”，可查詢國產(chǎn)藥品、進口藥品、藥品生產(chǎn)企業(yè)等信息。在“數(shù)據(jù)查詢”的下方，有藥品注冊進度查詢的鏈接。,如：點擊進入“國產(chǎn)藥品”，網(wǎng)站提供了“快速查詢”和“高級查詢”兩種檢索方式。,FDA（http://www.fda.gov/） 是美國醫(yī)療審核機構(gòu)，主要包括：食品安全和實用營養(yǎng)中心(CFSAN)、藥品評估和研究中心(CDER)、生物制品評估和研究中心(CBE

26、R)、獸用藥品中心(CVM)。FDA主要分測試和注冊兩個內(nèi)容，主管食品、藥品（包括獸藥）、醫(yī)療器械、食品添加劑、化妝品、動物食品及藥品等的測試、檢驗和出證。此外，還可以查到藥物安全信息、藥物特殊信息索引、藥物短缺信息、用藥錯誤信息等。,2、美國食品和藥物管理局（Food and Drug Administration，F(xiàn)DA）,該網(wǎng)站提供快速檢索功能（FAD Search），包括五個入口： 活性成分檢索（Search by

27、 Active Ingredient）、申請人檢索（Search by Applicant Holder）、商品名檢索（Search by Proprietary Name）、申請?zhí)枡z索（Search by Application Number）、專利號檢索（Search by Patent）。 還提供高頻問題FAQS(Frequently Asked Questions)， 以問答式列出一些常見問題幫助用戶。另外網(wǎng)站中還提

28、供常用的功能鏈接（如毒理學(xué)網(wǎng)站等），方便用戶查找相關(guān)信息。,3、毒理學(xué)網(wǎng)絡(luò)(http://toxnet.nlm.nih.gov),毒理學(xué)網(wǎng)絡(luò)(Toxnet , http://toxnet.nlm.nih.gov)提供了： 毒理學(xué)在線(TOXLINE)、有害物質(zhì)數(shù)據(jù)庫(HSDB)、 化學(xué)別名和結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)庫(ChemIDplus)、 基因突變毒理學(xué)(GENETOX)、發(fā)育和生殖毒理學(xué)(DART)、

29、 化合物環(huán)境毒理學(xué)評價(TRI)等數(shù)據(jù)庫。其中，TOXLINE常用的藥學(xué)文獻數(shù)據(jù)庫之一，包括藥物和化學(xué)物質(zhì)的毒理學(xué)、藥理學(xué)、生理學(xué)等內(nèi)容。聯(lián)機檢索TOXNET數(shù)據(jù)庫時，可以選擇某一個或全部數(shù)據(jù)庫進行檢索。,4、美國藥物不良反應(yīng)監(jiān)測網(wǎng)(MedWatch）,由FDA建立，用于藥品上市后的質(zhì)量跟蹤和監(jiān)測，以便及時發(fā)現(xiàn)臨床試驗中尚未揭示的不良反應(yīng)。該網(wǎng)站提供醫(yī)藥產(chǎn)品安全信息查詢，可以查看藥物、醫(yī)療器械的安全信息。還可以通過直報系

30、統(tǒng)向FDA提交藥物的不良反應(yīng)報告。,5、PharmaWeb(http://www.drugs.com/),PharmaWeb是第一個在互聯(lián)網(wǎng)上提供藥學(xué)信息的專業(yè)網(wǎng)站，其屬于資源整合網(wǎng)站，信息較全面，包括藥學(xué)、生物學(xué)、化學(xué)、世界各國藥學(xué)網(wǎng)等。該網(wǎng)站提供多項服務(wù)，擁有龐大的用戶群。,四、其它藥學(xué)信息資源及工具書（1）專利（2）藥典（3）醫(yī)藥手冊、索引（4）醫(yī)藥學(xué)年鑒（5）醫(yī)藥圖譜,1、專利藥學(xué)專利內(nèi)容包括歐洲專利局（htt

31、p://www.epo.org/）、美國專利局（http://patft.uspto.gov/）、中國專利局（http://www.sipo.gov.cn/）等。2、醫(yī)藥手冊、索引手冊是匯集某一學(xué)科或某一主題等需要經(jīng)常查找參考的資料，供讀者隨時翻檢的工具書。其特點是信息密集、內(nèi)容具體，文字簡潔、實用。常用的醫(yī)藥手冊包括：《默克手冊》(Merck Manuals)、《美國藥品索引》（American Drug Index，AD

32、I）、《全球藥物字典》（INDEX NOMINUM）、《中國新藥實用全集》等。,3、藥典 藥典是一個國家記載藥品標(biāo)準(zhǔn)、規(guī)格的法典，一般由國家藥品監(jiān)督管理局主持編纂、頒布實施，國際性藥典則由公認(rèn)的國際組織或有關(guān)國家協(xié)商編訂。藥典是從本草學(xué)、藥物學(xué)以及處方集的編著演化而來。藥典的重要特點是它的法定性和體例的規(guī)范化?，F(xiàn)在已有的藥典主要有：《國際藥典》（The International Pharmacopoeia，IP）、

33、《中華人民共和國藥典》、《美國藥典》（The United States Pharmacopoeia，USP）、《歐洲藥典》（European Pharmacopoeia，EP）、《英國藥典》（British Pharmacopoeia，BP）等。,4、醫(yī)藥學(xué)年鑒 年鑒是以全面、系統(tǒng)、準(zhǔn)確地記述年度事物運動、發(fā)展?fàn)顩r為主要內(nèi)容的資料性工具書。匯輯一年內(nèi)的重要時事、文獻和統(tǒng)計資料，按年度連續(xù)出版的工具書。