基于核糖體基因水平的我國(guó)大陸石磺科貝類分類和系統(tǒng)發(fā)育初步研究.pdf

1、石磺科（Onchidiidae）屬于屬軟體動(dòng)物門（Mollusca）、腹足綱（Gastropoda）、肺螺類（Pulmonata）、縮眼目（Systellommatophora）、石磺超科（Onchidioidea），廣泛分布于熱帶、亞熱帶的潮間帶、河口紅樹林區(qū)。在我國(guó)主要分布在南海、東海及黃海南部潮間帶。石磺科作為海淡水交匯區(qū)的過渡種，是研究軟體動(dòng)物由海洋到陸地進(jìn)化過程的重要模式種。石磺科的種類及分類狀況對(duì)研究我國(guó)大陸石磺科資源的保護(hù)

2、、開發(fā)有重要的意義。本研究采集大陸沿海5地共9個(gè)群體的石磺科貝類，首先以形態(tài)學(xué)分析方法將其進(jìn)行初步分類，以rRNA中18S、28S部分序列和ITS2序列對(duì)分類情況進(jìn)行驗(yàn)證并對(duì)各種屬問親緣關(guān)系進(jìn)行分析，以探討我國(guó)沿海石磺科內(nèi)屬、種的分類地位和系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系，為研究石磺科貝類的分類、分子生物學(xué)奠定基礎(chǔ)，為石磺科貝類資源的研究、開發(fā)、利用提供資料。實(shí)驗(yàn)結(jié)果表明： （一）形態(tài)學(xué)分析及初步分類采集樣品并記錄了主要分類學(xué)形態(tài)特征：身體顏色、腸

3、式、樹枝狀鰓有無、戀矢分叉情況、陰莖附屬腺的有無和直腸腺的有無。根據(jù)以上形態(tài)特征所得數(shù)據(jù)，結(jié)合英國(guó)學(xué)者Britton（1984）對(duì)我國(guó)香港地區(qū)所采集石磺的分類研究資料，將我國(guó)大陸沿海石磺科9個(gè)群體分為4屬7種，其中己知種2種，瘤背石磺Onchidiumstruma（即JZH）和石磺（海南藍(lán)紫和福建藍(lán)紫）Peroniaverruculata（即HNZ和FJZ）；其余5種為中國(guó)大陸新記錄種，初步命名為：（海南軟紅和福建軟紅）Paraonci

4、diumsp.（即HNR和FJR）、（海南腹足桔黃）Onchidiumsp.（HNJ）、（海南桔黃體硬）Onchidiumsp.（HNY）、（海南硬黑）Platevindexsp.（HNH）、（福建硬黑）Platevindexsp.（FJH）。 （二）基于18SrRNA、28SrRNA和ITS2序列系統(tǒng)發(fā)育分析利用BioEdit7.01、MEGA4.0、DnaSP4.0等軟件，對(duì)18SrRNA、28SrRNA和ITS2進(jìn)行同源序

5、列分析，以菊花螺為外類群，結(jié)合GenBank上石磺科rRNA基因序列構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)生樹，以驗(yàn)證根據(jù)形態(tài)特征對(duì)我國(guó)大陸沿海石磺科貝類所做的初步分類結(jié)果，探討我國(guó)大陸沿海石磺科各屬種間的親緣關(guān)系。18SrRNA、28SrRNA和ITS2序列所做的系統(tǒng)發(fā)生樹與形態(tài)分析結(jié)果一致，HNZ和FJZ、HNR和FJR分別為一個(gè)種Peroniaverruculata、Paraoncidiumsp.。同時(shí)，三個(gè)基因所做系統(tǒng)發(fā)生樹支持將海南石磺Onchidium

6、sp.（HNJ）、海南石磺Onchidiumsp.（HNY）和瘤背石磺（Onchidiumstruma）（JZH）同歸于Onchidium屬。關(guān)于Platevindex屬的2個(gè)群體（海南石磺Platevindexsp.（HNH）和福建石磺Platevindexsp.（FJH））的分類上，分子系統(tǒng)學(xué)分析結(jié)果與傳統(tǒng)的形態(tài)分類結(jié)果產(chǎn)生差異，分子系統(tǒng)學(xué)分析內(nèi)部也是不一致的，18S基因序列所做系統(tǒng)發(fā)生樹顯示：海南群體Platevindexsp。（

7、HNH）與Paraoncidium屬較為相近，福建群體Platevindexsp.（FJH）與Onchidium屬較為相近。28S序列缺失海南群體Platevindexsp.（HNH）數(shù)據(jù)，所作系統(tǒng)分析樹也顯示福建群體Platevindexsp.（FJH）與Onchidium屬較為相近。但I(xiàn)TS2序列分析發(fā)現(xiàn)Platevindex屬2群體有相同的單倍型，在系統(tǒng)發(fā)育樹上交叉分布，親緣關(guān)系較近。 3種基因序列所構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)生樹都顯示：

8、 1.Peronia屬與Paraoncidium屬的親緣關(guān)系較為相近。 2.Platevindex屬與Onchidium屬關(guān)系比較近，其中海南石磺Onchidiumsp。（HNY）和瘤背石磺（Onchidiumstruma）（JZH）親緣關(guān)系最近，福建石磺Platevindexsp.（FJH）與Onchidium屬的海南石磺Onchidiumsp.（HNJ）親緣關(guān)系較近。 3.3種基因序列所構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)生樹在Pla

9、tevindex屬2種與其他屬種的親緣關(guān)系上產(chǎn)生分歧。但是，它們共同點(diǎn)是在所有系統(tǒng)發(fā)生樹中，此2種與其他屬種聚合時(shí)的置信度都比較低。 （三）其他分子生物學(xué)信息在28S基因序列分析中，發(fā)現(xiàn)瘤背石磺（Onchidiumstruma）（JZH）的28S基因有兩種情況的較長(zhǎng)基因片段缺失。在25個(gè)個(gè)體中，24個(gè)個(gè)體在165bp-555bp片段，缺失390bp的序列；1個(gè)個(gè)體在456bp-518bp片段，缺失62bp長(zhǎng)度的序列，兩種情況的總